结论：投标的三家公司由一个人制作标书，甲方是否有责任，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、从招标流程合规性角度
若招标文件明确规定标书制作要求：
- 如果招标文件中明确规定了标书的制作要求，包括但不限于标书的独立性、原创性、不得由同一人或同一团队为多家投标人制作标书等，而实际投标过程中出现了三家公司的标书由一个人制作的情况，这明显违反了招标文件的规定。
- 在此情况下，甲方（招标人）如果未能及时发现并制止这一违规行为，或者在评标过程中未能根据招标文件的规定对违规投标进行相应处理（如废标、处罚等），那么甲方可能需要承担一定的管理责任或疏忽责任。但这种责任更多是基于招标流程管理上的疏忽，而非直接的法律责任。
若招标文件未明确规定标书制作要求：
- 如果招标文件中没有明确规定标书的制作要求，或者规定较为模糊，没有明确禁止同一人或同一团队为多家投标人制作标书，那么从招标流程合规性的角度来看，甲方可能不直接承担责任。
- 然而，即使招标文件没有明确规定，甲方也有义务确保招标过程的公平、公正和透明。如果甲方在评标过程中发现了三家公司的标书由一个人制作的情况，但未采取任何措施，这可能引发对甲方公正性的质疑，但不一定直接构成法律责任。
二、从法律责任角度
串通投标嫌疑：
- 三家公司的标书由一个人制作，可能引发串通投标的嫌疑。串通投标是违法行为，根据《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规的规定，串通投标的投标人将承担法律责任，包括但不限于罚款、没收违法所得、取消投标资格等。
- 如果甲方在招标过程中发现了串通投标的行为，但未及时报告或处理，或者与投标人串通一气，那么甲方也可能需要承担相应的法律责任，包括行政责任甚至刑事责任（如果构成犯罪的话）。
甲方无直接过错：
- 如果甲方在招标过程中严格遵守了相关法律法规和招标文件的规定，对投标人的标书制作情况进行了合理的审查和监督，但由于投标人的隐蔽行为或技术手段等原因未能发现三家公司的标书由一个人制作的情况，那么甲方可能不直接承担法律责任。
- 在此情况下，责任应主要由违规的投标人承担。
三、建议与措施
加强招标文件编制：
- 甲方在编制招标文件时，应明确规定标书的制作要求，包括但不限于标书的独立性、原创性、不得由同一人或同一团队为多家投标人制作标书等，以减少类似情况的发生。
严格审查投标文件：
- 甲方在评标过程中，应严格审查投标文件的真实性和合规性，包括但不限于对标书制作情况的调查和核实。如果发现三家公司的标书由一个人制作的情况，应及时进行处理，如废标、处罚等。
加强法律意识和风险防范：
- 甲方应加强对招标投标法律法规的学习和了解，提高法律意识和风险防范能力。在招标过程中，应严格遵守相关法律法规和招标文件的规定，确保招标过程的公平、公正和透明。
总结：投标的三家公司由一个人制作标书，甲方是否有责任需根据具体情况判断。如果招标文件有明确规定且甲方未履行管理职责，或者存在串通投标嫌疑且甲方未及时报告或处理，甲方可能需要承担一定的责任。但无论如何，甲方都应加强招标文件编制、严格审查投标文件以及加强法律意识和风险防范，以减少类似情况的发生。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。