针对您提出的小产权房被侵占如何立案的问题，这是一个涉及法律权益保护的重要议题。尽管小产权房在法律上可能存在一定的争议性，但您仍然有权采取一系列措施来维护自己的合法权益。以下是我为您详细梳理的立案处理流程：
一、明确权利基础与证据收集
确认权属：
- 您需要收集并整理所有能证明您对小产权房享有实际占有和使用权的材料，如购房合同、付款凭证、居住证明等。这些材料将作为您主张权利的基础。
收集侵占证据：
- 拍摄现场照片、视频，记录侵占行为的具体情况。
- 寻找可能的证人，并获取他们的证言，以证明侵占行为的存在。
二、尝试协商调解
与侵占者直接沟通：
- 在发现房屋被侵占后，首先尝试与侵占者进行友好沟通，了解其侵占的原因和意图，看是否能够通过协商达成和解。
寻求第三方调解：
- 如果双方无法直接达成协议，您可以寻求村委会、居委会或其他中立第三方的帮助进行调解。这些机构通常具有调解民间纠纷的经验和权威性。
三、报警处理
判断侵占行为性质：
- 如果侵占行为构成违法或犯罪，如非法侵入住宅、故意毁坏财物等，您应立即向当地公安机关报案。
配合公安机关调查：
- 提供您所收集的所有证据和材料，配合公安机关进行调查处理。如果公安机关认为构成犯罪，会依法立案侦查。
四、提起民事诉讼（需谨慎评估）
评估诉讼风险：
- 由于小产权房的合法性存在争议，法院在处理此类案件时可能会持谨慎态度。因此，在决定提起诉讼前，建议您咨询专业律师，全面评估胜诉的可能性和诉讼成本。
准备诉讼材料：
- 如果决定提起诉讼，您需要准备好起诉状、证据材料等，并按照法院的要求进行提交。确保所有材料真实、完整、有效。
参与诉讼过程：
- 在诉讼过程中，您需要积极配合法院的审理工作，提供必要的证据和材料，维护自己的合法权益。同时，也要尊重法院的判决结果。
五、考虑其他法律途径
行政投诉：
- 如果侵占行为涉及政府部门的违法行为，如违规拆迁、强制占用等，您可以向相关部门进行行政投诉，要求纠正违法行为并赔偿损失。
寻求法律援助：
- 如果您经济困难且符合法律援助条件，可以向当地法律援助机构申请法律援助。法律援助机构将为您提供专业的法律人士帮助和支持，降低您的维权成本。
综上所述，小产权房被侵占后，您可以通过明确权利基础与证据收集、尝试协商调解、报警处理、提起民事诉讼（需谨慎评估）以及考虑其他法律途径等方式来维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，建议及时咨询专业律师或相关机构以获取更具体的法律指导。