结论：股东不能直接起诉法人代表不还公司借款，但可以通过特定途径维护公司及自身权益，具体如下：
一、明确法律关系与主体
公司借款与法人代表个人借款的区别：
- 公司借款：是以公司名义进行的借款行为，借款合同的一方是公司，另一方是出借人。法人代表作为公司的代表，在借款合同上签字或盖章，但并不意味着借款是法人代表个人的。
- 法人代表个人借款：是以法人代表个人名义进行的借款行为，借款合同的一方是法人代表个人，另一方是出借人。
股东与公司的关系：
- 股东是公司的投资者，享有公司股权，但并不直接参与公司的日常经营管理（除非同时担任公司董事、监事或高级管理人员等职务）。
- 股东对公司享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利，但并不直接对公司债务承担责任（除非存在特定情形，如股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的）。
二、股东维护权益的途径
通过公司内部治理机制解决：
- 股东会或股东大会：股东可以提议召开股东会或股东大会，讨论并决定如何追讨法人代表未还的公司借款。如果法人代表同时是公司董事或高级管理人员，股东会或股东大会可以决定对其采取相应的内部纪律处分或解聘等措施。
- 监事会或监事：如果公司设有监事会或监事，股东可以向监事会或监事反映情况，要求其履行监督职责，对法人代表的行为进行调查，并采取必要的措施。
通过法律途径解决：
- 代表诉讼（股东派生诉讼）：在特定情形下，如法人代表的行为损害了公司利益，而公司又怠于行使诉权时，股东可以为了公司的利益以自己的名义直接向人民法院提起诉讼。但需要注意的是，代表诉讼有严格的适用条件，如股东需满足一定的持股时间和持股比例要求，且需先向公司提出书面请求并等待一定期限等。
- 直接诉讼（如涉及股东直接利益受损）：如果法人代表的行为同时损害了股东个人的直接利益（如通过不正当手段转移公司资产导致股东分红减少等），股东可以直接以自己的名义提起诉讼，要求法人代表承担赔偿责任。但这种情况较为少见，且需要股东提供充分的证据证明其直接利益受损。
其他途径：
- 向相关部门举报：如果法人代表的行为涉嫌违法犯罪（如挪用资金、职务侵占等），股东可以向公安机关、检察机关等相关部门举报，要求其依法查处。
- 协商和解：在可能的情况下，股东也可以尝试与法人代表进行协商和解，通过友好沟通的方式解决纠纷。
三、具体操作建议
- 收集证据：股东在采取任何行动之前，应首先收集相关证据，如借款合同、转账记录、法人代表的行为记录等，以证明法人代表未还公司借款的事实。
- 咨询专业律师：由于法律程序复杂且涉及专业法律知识，股东在采取行动前最好咨询专业律师的意见，以确保其行动合法有效。
- 遵循法律程序：无论采取哪种途径解决纠纷，股东都应遵循法律程序的要求，如按时提交诉讼材料、参加庭审等。
最后，股东在面对法人代表不还公司借款的情况时，应保持冷静和理性，通过合法途径维护公司及自身的权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。