农民专业合作社名义承包的土地，其所有权属于集体，而承包经营权属于农民专业合作社这一法人主体。具体分析如下：

1. 土地所有权归属集体
   根据《中华人民共和国土地管理法》第九条，农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有。因此，无论土地以何种方式承包或流转，其所有权始终归属于集体，不会因承包主体变化而改变。

2. 承包经营权归属法人（合作社）
   农民专业合作社作为依法登记的法人组织，若通过合法程序（如与集体经济组织签订承包合同）取得土地承包经营权，则该权利由合作社享有。根据《中华人民共和国农村土地承包法》第五十三条，通过家庭承包方式取得的土地承包经营权可以依法采取转包、出租、互换、转让或其他方式流转；而通过招标、拍卖、公开协商等方式承包的“四荒地”等，承包方也可依法流转经营权。合作社作为承包方，其经营权受法律保护。

3. 关键区分：所有权与经营权分离
   需明确的是，集体拥有土地所有权，而合作社拥有的是基于承包合同的经营权。二者性质不同：所有权是物权，具有永久性；经营权是用益物权，受合同期限限制（如耕地承包期为30年）。若合作社解散或合同终止，土地应返还集体，但地上附着物（如农作物、设施）的处置需按合同约定或法律规定处理。

实务建议：

• 合作社应妥善保管承包合同，明确约定经营权期限、流转条件及违约责任；
  
• 若涉及土地流转（如转包、入股），需依法报发包方备案，避免因程序瑕疵导致权利受损；
  
• 集体经济组织应监督合作社按约定用途使用土地，防止擅自改变土地农业用途。
  

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