在协议上盖合作社章，主要起到确认协议主体身份、证明协议合法性及增强协议证明力的作用。具体分析如下：

1. 确认协议主体身份：

   • 合作社作为一个独立的法律实体，具有签订合同和承担法律责任的资格。在协议上加盖合作社的公章，即表明该协议是由合作社作为一方主体签订的，明确了协议的法律关系和责任归属。

2. 证明协议的合法性：

   • 公章是合作社合法存在的象征，也是其行使权力的标志。在协议上加盖公章，可以视为合作社对协议内容的认可和接受，从而证明该协议是合法有效的。这有助于在后续的法律纠纷中，作为证明协议合法性的重要证据。

3. 增强协议的证明力：

   • 在法律上，公章具有较高的证明力。一份加盖了合作社公章的协议，相比没有加盖公章的协议，更具有说服力和可信度。这有助于在协议履行过程中，减少因协议真实性或合法性而产生的争议和纠纷。

注意事项：

• 在签订协议时，应确保合作社的公章是真实有效的，且加盖公章的行为得到了合作社的合法授权。否则，该协议可能因主体不适格或盖章行为无效而面临法律风险。
• 除了加盖公章外，协议的内容也应明确、具体、合法，并符合双方的真实意愿。这样才能确保协议的有效性和可执行性。

建议：

• 在签订涉及较大金额或重要权益的协议时，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保协议的合法性和有效性。
• 如果对合作社的公章真实性或盖章行为有疑问，可以要求合作社提供相关的证明文件或授权书，以核实其合法性和真实性。

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