违反施工许可证内容施工的处罚依据主要包括《中华人民共和国建筑法》和《建筑工程施工许可管理办法》中的相关规定。具体分析如下：
《中华人民共和国建筑法》第六十四条
该条款明确规定，若施工单位未取得施工许可证或违反施工许可证内容擅自施工，县级以上人民政府建设行政主管部门有权责令其改正。若拒不改正，将面临工程合同价款1%以上2%以下的罚款。这一规定直接针对未取得许可证或违反许可证内容的施工行为，明确了处罚主体和罚款计算标准。
《建筑工程施工许可管理办法》第十二条、第十五条
- 第十二条：对于未取得施工许可证擅自施工的行为，建设单位和施工单位需共同承担责任。处罚措施包括责令停止施工、限期改正，并对建设单位处以工程合同价款1%以上2%以下的罚款，对施工单位处以3万元以下罚款。
- 第十五条：若施工单位未按照施工许可证规定的内容施工（如擅自扩大施工范围、变更建设单位等），同样会被责令停止施工并限期改正。若拒不改正，将面临与第十二条相同的罚款标准。这一条款进一步细化了对“违反许可证内容”行为的处罚依据。
处罚的核心要素：
- 处罚主体：县级以上人民政府建设行政主管部门（如住建局）。
- 处罚对象：建设单位和施工单位（根据具体违法行为确定责任主体）。
- 处罚措施：包括责令改正、停止施工、罚款等，罚款金额与工程合同价款或违法行为性质挂钩。
- 例外情形：若违法行为发生在工程投资额不足30万元或建筑面积不足300平方米的建筑工程中，可能不适用施工许可制度（依据《建筑工程施工许可管理办法》第二条第二款），但需以地方具体规定为准。
建议：
若您或您的企业涉及此类问题，建议立即停止违规施工行为，主动与建设行政主管部门沟通整改方案，并保留相关证据（如施工合同、许可证文件等）以备核查。若对处罚决定有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律适用问题。