取保候审保证金多交的部分，司法机关会依法退还，不会因多交而产生额外法律后果，但需通过法定程序申请退还。以下是具体分析：

1. 保证金性质与多交后果
   取保候审保证金是犯罪嫌疑人、被告人为保证不逃避或妨碍侦查、起诉、审判，向司法机关缴纳的现金担保。其金额由司法机关根据案件性质、社会危险性、经济状况等因素综合确定（《刑事诉讼法》第72条）。若当事人或家属自愿多交，超出法定金额的部分不具有法律约束力，司法机关无权没收或占用。

2. 多交部分的退还程序

   • 申请主体：当事人或其法定代理人、近亲属可向作出取保候审决定的机关（如公安机关、检察院、法院）提出退还申请。
     
   • 申请材料：需提交书面申请、保证金缴纳凭证（如收据）、身份证明等文件。
     
   • 审核与退还：司法机关应在3日内审核，确认多交事实后，将超出部分退还至原缴纳账户或指定账户（《公安机关办理刑事案件程序规定》第97条）。
     
   • 特殊情形：若案件已进入下一阶段（如移送检察院审查起诉），需向当前办案机关申请退还。

3. 注意事项

   • 保留凭证：务必妥善保存保证金缴纳收据，这是证明多交金额的关键证据。
     
   • 及时申请：若案件终结（如撤销案件、不起诉、判决生效），应立即申请退还，避免因司法机关内部流程延误。
     
   • 异议处理：若司法机关拒绝退还，可要求其出具书面说明，并依法申请行政复议或提起行政诉讼。

建议：若您或家属遇到此类情况，可先与办案机关沟通确认多交金额，再按程序提交申请。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程。