关于小区车库失火烧毁电瓶车的赔偿问题，需根据火灾原因、责任主体及保险情况综合判断，具体分以下几种情况处理：

1. 若火灾由第三方人为原因引发（如纵火、违规操作等）
   根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应承担侵权责任。此时需通过消防部门出具的《火灾事故认定书》确定责任人，受害车主可直接向责任人索赔车辆实际损失（需提供购车发票、维修记录等证明价值）。若责任人拒赔，可向法院起诉要求赔偿车辆重置费用、合理交通费等。

2. 若火灾因车库管理方（物业）未尽安全义务导致
   根据《民法典》第942条，物业对共有部分负有安全保障义务。若因物业未配置消防设施、未及时清理易燃物、未制止违规充电等行为导致火灾，物业需承担相应赔偿责任。车主可要求物业赔偿车辆损失，若物业已购买公众责任险，可由保险公司直接赔付。

3. 若车主自身存在过错（如违规改装、私拉电线充电等）
   根据《民法典》第1173条，被侵权人对同一损害的发生有过错的，可减轻侵权人责任。例如车主私拉电线充电引发火灾，可能需自行承担部分损失，具体比例由法院根据过错程度判定。

4. 若火灾原因无法查明或属意外事件
   若消防部门无法确定起火原因，或认定属不可抗力（如雷击），且无明确责任方时，车主需通过自身保险（如车损险）理赔。若未投保，则可能需自行承担损失。但若物业未尽基本安全保障义务（如未配备消防设施），仍可能需承担部分补充责任。

实务建议：

• 立即报警并要求消防部门出具《火灾事故认定书》，这是后续索赔的关键证据；
  
• 保存车辆购买凭证、维修记录等证明价值的材料；
  
• 若物业或责任方拒赔，可向当地房管部门投诉或直接起诉；
  
• 建议车主为电瓶车投保财产险，降低意外损失风险。
  

如有进一步细节（如是否签订物业合同、火灾具体原因等），可继续向我咨询，我会结合具体证据分析赔偿路径。