核心结论：在“起诉在先、租房在后，房子被法院查封”的情况下，租客的权益会受到一定影响，但并非完全无法保障，具体处理方式需结合租赁合同效力、查封性质及租客是否善意等因素综合判断。以下是具体分析：

1. 租赁合同效力与查封的关系

• 若租赁合同签订于查封前（但您的情况是“租房在后”，故不适用此情形）：根据《民法典》第725条，租赁物在承租人按照租赁合同占有期限内发生所有权变动的，不影响租赁合同的效力（即“买卖不破租赁”）。但查封属于限制物权变动的强制措施，若查封在先、租赁在后，租赁合同可能因“恶意串通损害第三人利益”或“违反法律强制性规定”被认定无效或部分无效。
• 若租赁合同签订于查封后：租赁合同可能因违反《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第24条（“被执行人就已经查封、扣押、冻结的财产所作的移转、设定权利负担或者其他有碍执行的行为，不得对抗申请执行人”）而无法对抗申请执行人，法院有权要求租客腾退房屋。

2. 租客的权益保护路径

• 主张善意取得租赁权：若租客在租房时不知房屋已被查封（即“善意”），且已实际占有使用房屋，可尝试向法院提出执行异议，要求继续履行租赁合同或主张优先购买权（若房屋被拍卖）。需提供租房合同、付款凭证、实际居住证明等材料。
• 要求出租人赔偿损失：若出租人故意隐瞒房屋被查封的事实，导致租客无法正常使用房屋，租客可依据《民法典》第577条（违约责任）或第500条（缔约过失责任）要求出租人赔偿租金损失、搬迁费用等实际损失。
• 参与分配拍卖款：若房屋被拍卖，租客作为债权人有权参与分配拍卖款，但优先级低于抵押权人、建设工程价款优先受偿权人等。

3. 实务建议

• 立即收集证据：包括租赁合同、租金支付记录、房屋现状照片、与出租人的沟通记录等，以证明租赁关系真实存在且租客无过错。
• 向法院提出书面异议：根据《民事诉讼法》第234条，在执行过程中，案外人对执行标的提出书面异议的，法院应当自收到书面异议之日起15日内审查并作出裁定。
• 咨询专业律师：若案件复杂（如涉及多轮查封、抵押权冲突等），建议委托律师协助分析租赁合同效力、查封程序合法性及执行异议策略，以最大限度维护权益。

总结：您的情况需优先确认租赁合同签订时间与查封时间的先后顺序，若租赁在查封后，租客权益可能受限，但仍可通过执行异议、赔偿诉讼等途径争取部分补偿。建议尽快行动，避免因房屋被处置导致证据灭失或权益进一步受损。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。