针对您提出的“土地承包合同补充协议村民小组签字、村长签字并加盖村章是否有效”的问题，以下是我的详细解答：
首先，要明确的是，土地承包合同及其补充协议的有效性并非仅由村民小组签字、村长签字和加盖村章来决定，而是需要满足一系列法定条件。
一、合同有效的基本前提
主体适格：
- 发包方必须是依法享有发包土地权利的村集体经济组织或村民委员会。
- 承包方需为本集体经济组织的成员，或符合法律规定的其他主体（如外村人员需经过特定程序同意并报批）。
意思表示真实：
- 合同双方的签约意愿必须真实、自愿，不存在欺诈、胁迫等不正当手段。
内容合法合规：
- 合同条款必须遵守《农村土地承包法》及相关法律法规的强制性规定。
- 土地用途需符合农业用地规划，不得擅自改变为非农用途。
形式符合要求：
- 土地承包合同及其补充协议应采用书面形式，并由双方签字或盖章。
- 合同应明确承包范围、期限、费用等关键条款。
二、关于村民小组签字、村长签字和加盖村章
- 村民小组签字：村民小组作为村集体的一部分，其签字可以视为对合同内容的认可，但并非合同有效的唯一决定因素。
- 村长签字：村长作为村民委员会的负责人，其签字代表了村民委员会的意志，但同样需要满足其他法定条件。
- 加盖村章：村章是村民委员会的官方印章，其加盖可以视为合同得到了村民委员会的正式认可。然而，仅凭村章加盖并不能保证合同的有效性，还需结合其他条件综合判断。
三、合同有效的额外条件
除了上述基本前提外，土地承包合同及其补充协议还需满足以下条件：
- 民主议定程序：土地承包需经过村民会议或村民代表会议的讨论决定，确保承包过程符合集体意志。
- 政府批准：合同需报经乡、镇人民政府批准，以确保合同的合法性和合规性。
四、合同效力存疑或无效的情形
- 如果村民小组签字、村长签字或加盖村章的程序不合法（如未经民主议定程序），合同可能被认定为无效或可撤销。
- 如果合同内容违法或损害集体利益，合同同样可能被认定为无效。
- 超越村委或村民小组权限的签字和盖章行为也可能导致合同无效。
五、实践建议
- 确保合同内容的明确性与合法性：在签订土地承包合同及其补充协议时，应详细列明合同条款，避免模糊不清或违法违规的内容。
- 严格履行民主议定程序与政府批准手续：确保土地承包过程符合法定程序，保障合同的合法性和透明度。
- 及时登记备案：合同签订后，应到相关土地管理部门进行登记备案，以确保合同的法定效力。
- 寻求法律咨询：在签订合同时，建议咨询专业律师，以确保合同的合法性和有效性，降低法律风险。
综上所述，土地承包合同补充协议村民小组签字、村长签字并加盖村章并不一定保证合同的有效性。合同的有效性还需满足其他多项法定条件，包括主体适格、意思表示真实、内容合法合规、形式符合要求以及履行民主议定程序和政府批准手续等。因此，在签订土地承包合同及其补充协议时，应严格遵守相关法律法规和程序要求，确保合同的合法性和有效性。