在客户委托乙方进行APP上架并申请软件著作权（软著）的情况下，著作权人原则上应为委托方，即客户，但具体还需根据双方签订的合同内容来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 一般原则：

   • 根据《中华人民共和国著作权法》的相关规定，受委托创作的作品，著作权的归属由委托人和受托人通过合同约定。合同未作明确约定或者没有订立合同的，著作权属于受托人。但在APP开发及上架的情境中，通常客户（委托方）会明确要求乙方（受托方）在开发完成后将著作权转让给客户，或者双方在合同中直接约定著作权归客户所有。

2. 合同约定的重要性：

   • 在实际操作中，为了避免后续的纠纷，双方应在合同中明确约定著作权的归属。如果合同中明确规定了著作权归客户所有，那么乙方在申请软著时，应将客户列为著作权人。
   • 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么根据法律规定，著作权可能归乙方所有。但这种情况在实际操作中较为少见，因为客户通常会要求拥有自己委托开发的APP的著作权。

3. 申请软著时的注意事项：

   • 在申请软著时，需要提交一系列的材料，包括软件源代码、设计文档、著作权归属声明等。其中，著作权归属声明是明确著作权人的重要文件。
   • 如果双方在合同中已经约定了著作权归客户所有，那么乙方在申请软著时，应确保著作权归属声明中明确写明客户为著作权人。

4. 可能的风险与防范：

   • 如果乙方在未经客户同意的情况下，擅自将著作权登记在自己名下，可能构成侵权行为，需要承担相应的法律责任。
   • 为了防范这种风险，客户可以在合同中明确约定乙方在申请软著时的义务，包括但不限于提交正确的著作权归属声明、配合客户进行软著的变更登记等。

建议：

• 在委托乙方进行APP开发及上架时，客户应与乙方签订详细的合同，明确约定著作权的归属以及乙方在申请软著时的义务。
• 如果双方对著作权的归属有争议，或者乙方在申请软著时未按照合同约定进行，客户可以及时向乙方提出异议，并寻求法律途径解决纠纷。

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