结论：电子合同在已经开具普通发票（普票）且抬头与合同不一致的情况下，能否修改抬头取决于多个因素，包括合同的具体条款、双方协商的结果以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

一、合同条款的约定

1. 合同中有明确约定：

   • 如果电子合同中明确规定了发票开具的相关条款，包括发票抬头的具体要求，那么双方应当遵循合同约定。若已开具的发票抬头与合同约定不符，且合同中未规定修改流程或条件，则修改抬头可能需要双方协商一致，并可能涉及合同变更或补充协议。

2. 合同中无明确约定：

   • 若合同中未明确规定发票开具的具体条款，包括发票抬头，那么双方可以根据实际情况和交易习惯进行协商。在协商一致的基础上，可以签订补充协议或变更合同，以明确发票抬头的修改事宜。

二、双方协商的结果

1. 双方同意修改：

   • 如果双方就发票抬头的修改达成一致意见，那么可以通过签订补充协议或变更合同的方式，对原合同中的相关条款进行修改，以反映新的发票抬头。

2. 双方无法达成一致：

   • 若双方无法就发票抬头的修改达成一致意见，那么可能需要通过法律途径解决争议。在此情况下，建议双方保留好相关证据，如合同、发票、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

三、相关法律法规的规定

1. 发票管理规定：

   • 根据《中华人民共和国发票管理办法》等相关规定，发票的开具应当真实、准确、完整地反映交易内容。如果发票抬头与合同不一致，可能涉及发票的真实性和准确性问题。因此，在修改发票抬头时，需要确保符合相关法律法规的规定。

2. 税务合规性：

   • 修改发票抬头还可能涉及税务合规性问题。如果修改后的发票抬头与实际交易不符，可能导致税务风险。因此，在修改发票抬头前，建议咨询专业税务人员或律师，以确保税务合规性。

四、实际操作建议

1. 沟通协商：

   • 首先，建议双方进行充分沟通协商，明确发票抬头的修改意愿和条件。在协商过程中，可以参考合同条款、交易习惯以及相关法律法规的规定。

2. 签订补充协议或变更合同：

   • 如果双方就发票抬头的修改达成一致意见，建议签订补充协议或变更合同，以明确修改后的发票抬头以及相关责任和义务。

3. 咨询专业人士：

   • 在修改发票抬头前，建议咨询专业税务人员或律师，以确保修改过程的合法性和合规性。他们可以提供具体的法律建议和操作指导。

后续行动建议：如果您在修改电子合同发票抬头的过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专注于刑事辩护和合同纠纷领域的专业律师，我将为您提供全面、准确的法律建议和解决方案。