若新分的土地未被纳入土地承包经营权证，可按以下步骤处理：

1. 核查土地分配的合法性
   首先需确认土地分配是否符合法定程序。根据《农村土地承包法》第19条，土地承包应经村民会议三分之二以上成员或村民代表同意，并报乡（镇）人民政府批准。若分配程序存在瑕疵（如未履行民主议定程序、未签订书面承包合同），可向村委会或乡镇政府申请补正程序，重新签订承包合同并办理权属登记。

2. 申请补发或变更土地承包经营权证
   若土地分配合法但未登记，需携带以下材料向县级农业农村部门申请补发或变更：

   • 土地承包合同（需包含新分土地的四至范围、面积等信息）；
     
   • 村委会出具的分配证明（需加盖公章并由负责人签字）；
     
   • 身份证明及原土地承包经营权证（如有）。
     根据《农村土地承包经营权证管理办法》第15条，农业农村部门应在收到申请后30个工作日内完成审核并补发新证。

3. 通过行政复议或诉讼解决争议
   若相关部门拒绝办理或存在权属争议（如其他村民主张权利），可采取以下途径：

   • 行政复议：向县级人民政府或上一级农业农村部门申请复议，要求撤销原不予登记决定并责令重新办理；
     
   • 行政诉讼：直接向法院提起行政诉讼，请求确认土地承包关系有效并判令行政机关履行登记职责。
     根据《行政诉讼法》第46条，此类案件的起诉期限为知道行政行为之日起6个月内。

4. 特殊情形处理

   • 土地流转后未变更登记：若新分土地已通过合法流转（如转包、出租）取得，需原承包方配合办理变更登记，否则流转合同仅对双方有效，无法对抗第三人；
     
   • 继承或赠与取得土地：需提供公证书或生效法律文书作为权属依据，并按照《不动产登记暂行条例》申请转移登记。

建议优先通过协商或行政途径解决，若争议复杂或涉及多方利益，可进一步向我提供具体细节（如分配程序、争议对方身份等），我将协助分析证据并制定诉讼策略。