结论前置：在一般情况下，公司在医疗期内且员工怀孕的情况下，不得辞退员工。但在特定情形下，如员工严重违反规章制度、严重失职或被依法追究刑事责任等，公司可以依法解除劳动合同。

一、一般情况下的保护规定

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照该法第四十条（无过失性辞退）、第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，在医疗期内且员工怀孕的情况下，员工享有特殊的劳动保护，公司不得随意辞退。

2. 理由：

   • 怀孕期员工身心处于特殊时期，需要特别照顾和保护。医疗期内的员工本身就处于需要休息和治疗的阶段，如果此时被辞退，无疑会加重其身心负担，也不利于其康复和后续的工作生活。
   • 保障怀孕期员工的就业稳定，是对妇女权益的尊重和保护，也是社会文明和进步的体现。

二、特定情况下的例外情形

尽管有上述保护规定，但在特定情况下，公司仍然可以依法解除与怀孕期员工的劳动合同：

1. 严重违反用人单位规章制度：

   • 具体情形：如多次旷工、违反保密制度、在工作场所打架斗殴等，严重扰乱公司正常工作秩序。
   • 法律要求：公司需证明其规章制度的制定经过民主程序且已向劳动者公示，同时证明劳动者的行为确实达到了“严重违反”的程度。

2. 严重失职、营私舞弊，给公司造成重大损害：

   • 具体情形：如负责财务工作的怀孕期员工挪用公司资金用于个人投资，或收受供应商贿赂导致采购高价低质原材料等。
   • 法律要求：公司需明确“重大损害”的具体标准，并提供充分证据证明员工的失职或舞弊行为与公司所遭受的重大损害之间存在直接因果关系。

3. 被依法追究刑事责任：

   • 具体情形：如怀孕期员工因犯罪行为被人民法院判处有期徒刑、拘役等刑罚。
   • 法律后果：在此情况下，公司可以依法解除与该员工的劳动合同。

三、违法辞退的法律后果

如果公司违法辞退怀孕期员工，员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。赔偿金的标准是经济补偿标准的二倍，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。例如，如果员工在公司工作了5年，那么公司需要支付10个月的工资作为赔偿金。

四、建议与总结

1. 对于公司：在处理怀孕员工的劳动关系时，必须严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到充分保护。如果公司有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，以确保决策合法合规，避免不必要的法律风险。

2. 对于员工：如果遭遇违法辞退，应勇敢维护自己的合法权益，可以要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。同时，也可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。

总之，医疗期内且员工怀孕的情况下，公司一般不得辞退员工。但在特定情形下，如员工严重违反规章制度、严重失职或被依法追究刑事责任等，公司可以依法解除劳动合同。双方都应了解并遵守相关法律法规，以维护自己的合法权益。