结论是：虚拟合同套取科研经费1千元是违法的行为。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律定性
诈骗行为：虚拟合同套取科研经费，本质上是通过虚构事实、隐瞒真相的方式，骗取科研经费的占有和使用权。这种行为符合诈骗罪的构成要件，即以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。虽然1千元的金额可能未达到某些地区诈骗罪的刑事立案标准（一般诈骗罪的刑事立案标准为3000元至1万元以上，具体因地区而异），但仍然属于违法行为，可能受到行政处罚。
违反科研经费管理规定：科研经费通常有严格的管理和使用规定，要求专款专用、真实合理。虚拟合同套取科研经费，显然违反了这些规定，破坏了科研经费的管理秩序。
二、法律后果
行政处罚：对于虚拟合同套取科研经费的行为，即使金额较小，也可能受到行政处罚，如罚款、警告等。具体处罚措施会根据行为的性质、情节以及造成的后果等因素由相关部门决定。
刑事责任：如果套取科研经费的金额达到刑事立案标准，或者行为情节严重（如多次套取、套取后挥霍等），则可能构成诈骗罪，需要承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。
民事赔偿：除了行政处罚和刑事责任外，虚拟合同套取科研经费的行为还可能引发民事赔偿。如果因该行为给科研机构或相关方造成损失，行为人需要承担赔偿责任。
三、实际建议
立即停止违法行为：如果你或他人正在实施虚拟合同套取科研经费的行为，应立即停止，避免进一步违法和造成更严重的后果。
主动说明情况：如果已经实施了该行为，建议主动向相关部门说明情况，配合调查，争取从轻或减轻处罚。
加强法律意识：科研经费的管理和使用应严格遵守法律法规和规章制度，加强法律意识，避免因为无知或疏忽而违法。
如果你或他人涉及虚拟合同套取科研经费的问题，或者有任何法律疑问，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。