针对您提出的“亲子鉴定孩子不是男方的怎么上户口”的问题，这确实是一个涉及法律程序和户籍管理规定的复杂情况。以下是我为您详细梳理的解答流程和建议：
一、理解亲子鉴定与上户口的关系
首先，需要明确的是，亲子鉴定在上户口的过程中，主要是用于确认亲子关系，特别是当出生证明上没有父亲信息，或者存在其他需要证明亲子关系的情形时。然而，如果亲子鉴定结果显示孩子不是男方的，这将对上户口的流程产生直接影响。
二、亲子鉴定结果非男方时的处理
确认亲子关系：
- 如果亲子鉴定结果显示孩子不是男方的，那么男方在法律上并不承担对孩子的抚养义务，除非他自愿承担。
- 在这种情况下，如果女方希望孩子随自己落户，通常需要提供其他证明亲子关系的材料，如出生证明（如果已包含母亲信息）、医院分娩记录等。
咨询当地户籍管理部门：
- 由于户籍管理政策可能因地区而异，因此建议您首先咨询当地户籍管理部门或派出所，了解具体的落户要求和所需材料。
- 他们可能会要求您提供额外的证明文件，如法院判决书（如果涉及抚养权争议）、亲子关系声明书等。
考虑法律途径：
- 如果亲子鉴定结果引发了抚养权争议或其他法律问题，您可能需要寻求法律帮助，通过法院来确认亲子关系和抚养权。
- 法院的判决书将作为具有法律效力的文件，用于上户口等后续手续。
三、上户口的具体流程（假设已解决亲子关系问题）
选择正规鉴定机构（如需再次鉴定）：
- 如果户籍管理部门要求再次进行亲子鉴定，您必须选择具有《司法鉴定许可证》的正规机构进行。
- 确保机构业务范围包含“法医物证司法鉴定”，且实验室通过国家CNAS认证。
准备相关证件和材料：
- 根据户籍管理部门的要求，准备所有被鉴定人（通常是母亲和孩子）的有效证件，如身份证、户口本等。
- 提供孩子的出生证明（如果已包含母亲信息）或其他证明亲子关系的材料。
现场办理和采样：
- 按照鉴定机构的要求，所有被鉴定人需同时到场进行现场采样（如采血或口腔拭子）。
- 鉴定机构工作人员将核对身份、拍照存档，并按照司法程序进行采样。
等待鉴定报告：
- 通常5-7个工作日出鉴定报告，加急服务可能更快但需额外付费。
- 确保报告上加盖司法鉴定专用章和钢印，以确保其法律效力。
提交报告并办理落户手续：
- 将鉴定报告和其他所需材料提交给户籍管理部门或派出所。
- 按照他们的要求填写相关表格并办理落户手续。
四、注意事项和常见问题解答
- 费用问题：司法亲子鉴定的费用因机构和地区而异，通常在全国统一价范围内（如2600-3900元三人鉴定）。请警惕低价陷阱，选择正规机构。
- 报告有效期：司法亲子鉴定报告通常长期有效，但部分机构可能要求半年或一年内的报告。建议提前与户籍管理部门确认。
- 孩子太小能否做鉴定：出生满3天的孩子就能做亲子鉴定，新生儿通常采足跟血或指尖血。
- 父亲不在场能否做鉴定：如果亲子鉴定结果非男方，且男方不参与后续落户手续，则通常只需母亲和孩子进行鉴定。但具体需根据户籍管理部门的要求来确定。
五、建议
- 在处理此类复杂情况时，建议寻求专业法律人士的帮助，以确保您的权益得到充分保护。
- 保持与户籍管理部门的良好沟通，及时了解政策变化和所需材料，以便高效完成落户手续。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。