结论：夫妻双方同意跟第三者签订赔偿协议给第三者赔付，该协议是否具有法律效应，需根据具体情况来判断，一般情况下，若协议内容合法且不存在无效情形，则具有法律效应。以下从多个角度进行分析：

一、协议内容合法性

1. 协议目的合法：赔偿协议的目的必须合法，不能违反法律、行政法规的强制性规定，也不能违背公序良俗。例如，如果赔偿是因为夫妻一方与第三者存在不正当关系，而试图通过赔偿来掩盖这种不正当关系或达到其他非法目的，那么这样的协议很可能是无效的。

2. 协议内容明确：协议中应明确赔偿的原因、金额、支付方式等关键条款。如果协议内容模糊不清，或者存在歧义，那么可能会影响协议的效力。

二、协议签订过程

1. 双方自愿：赔偿协议必须是夫妻双方和第三者自愿签订的，不能存在欺诈、胁迫等情形。如果一方是在被欺诈或胁迫的情况下签订的协议，那么该协议是可以被撤销的。

2. 具备完全民事行为能力：签订协议的各方必须具备完全民事行为能力，即能够独立进行民事活动并承担民事责任。如果一方是无民事行为能力人或限制民事行为能力人，那么其签订的协议可能是无效的。

三、协议可能无效的情形

1. 违反法律强制性规定：如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该协议是无效的。例如，如果协议中约定的赔偿金额过高，超出了法律规定的范围，或者协议中涉及了非法活动，那么这样的协议就是无效的。

2. 恶意串通损害他人利益：如果夫妻双方与第三者恶意串通，通过签订赔偿协议来损害其他人的利益，如夫妻共同财产的其他共有人、债权人的利益等，那么该协议也是无效的。

四、法律建议

1. 谨慎签订协议：在签订赔偿协议前，夫妻双方应充分了解协议的内容和法律后果，确保协议的目的合法、内容明确、签订过程自愿且各方具备完全民事行为能力。

2. 咨询专业律师：由于赔偿协议涉及复杂的法律问题，建议夫妻双方在签订协议前咨询专业律师的意见，以确保协议的合法性和有效性。

3. 保留证据：在签订和履行协议过程中，各方应保留好相关证据，如协议文本、支付凭证等，以备不时之需。

举例说明：假设夫妻双方因为一方与第三者存在不正当关系而签订赔偿协议，约定向第三者支付一定金额的赔偿。如果该协议的目的并非为了掩盖不正当关系或达到其他非法目的，而是出于双方自愿且协议内容合法明确，那么该协议是具有法律效应的。但如果协议中约定的赔偿金额过高，超出了法律规定的范围，或者协议签订过程中存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议可能是无效的。

后续行动建议：如果您或您身边的人遇到了类似的问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况为您提供专业的法律意见和帮助。