每日千分之一的违约金并非绝对合法或非法，其合法性取决于合同类型、双方当事人的约定、实际损失情况以及法律适用等多个因素。以下是对此问题的详细分析：
一、一般民事合同中的违约金
原则有效：在民事合同中，双方当事人遵循意思自治原则，可以自行约定违约金的数额或计算方式。如果双方在平等、自愿、公平的基础上达成一致，约定每日千分之一的违约金，这一约定在原则上是有效的。
可能调整：然而，如果因违约金纠纷诉至法院，法院会对约定的违约金进行审查。若一方认为违约金过高并请求调整，法院会综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度、预期利益以及实际损失等因素。特别是当每日千分之一的违约金换算成年化利率达到较高水平（如36.5%）时，在很多情况下会被认为过高，法院可能会酌情将其调整至合理水平。通常，法院会参考民间借贷利率司法保护上限等标准，如一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍，来判定违约金是否过高。
计算公式示例（假设以一年期LPR的4倍为上限）：
二、特殊合同（如金融借款合同）中的违约金
在金融借款合同等特殊合同中，由于金融监管政策及相关法律的严格规定，对违约金的收取有更为严格的限制。每日千分之一的违约金可能因违反监管规定或被认定为过高而不被支持。金融机构在设置违约金条款时，必须遵守监管部门关于利率、费用等方面的具体规定。
三、违约金与定金的关系
如果合同中同时约定了违约金和定金，根据法律规定，当事人在违约时只能选择其中之一来主张。这意味着，即使合同中约定了每日千分之一的违约金，如果还同时存在定金条款，且定金足以弥补损失，那么当事人可能无法同时主张违约金和定金。
四、实际操作建议
明确合同条款：在签订合同时，务必明确约定违约金的数额、计算方式及适用条件，以减少后续纠纷的可能性。
合理预估损失：在设定违约金前，双方应充分评估可能因违约造成的损失，确保约定的违约金数额既不过高也不过低。这有助于维护合同的公平性和有效性，并减少因违约金过高或过低而引发的纠纷。
依法解决争议：一旦发生违约争议，双方应首先尝试通过友好协商解决。若协商无果，应及时寻求法律途径，向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，以确保自身权益得到妥善保护。
综上所述，每日千分之一的违约金是否合法，不能一概而论，而是需要根据具体的合同类型、双方当事人的约定、实际损失情况以及法律适用等多方面因素进行综合判断。如果你在合同签订或履行过程中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。