结论：还贷款金额不够但已经还了，是否算逾期，这主要取决于贷款合同中的具体约定以及贷款机构的相关规定。
详细分析：
贷款合同约定：
- 贷款合同是借款人与贷款机构之间约定贷款条件、还款方式、还款期限等关键条款的法律文件。
- 如果合同中明确规定了还款金额必须达到某一特定数额，而借款人未达到该数额，即使已经还款，也可能被视为逾期。
- 反之，如果合同中没有明确规定还款金额的具体要求，或者允许部分还款，那么借款人即使还款金额不够，也不一定被视为逾期。
贷款机构规定：
- 除了贷款合同外，贷款机构也可能有自己的还款规定和操作流程。
- 有些贷款机构可能对于还款金额不足的情况有特定的处理方式，如收取滞纳金、罚息等，但不一定直接视为逾期。
- 因此，借款人需要了解并遵守贷款机构的相关规定，以避免不必要的麻烦。
实际操作中的常见情况：
- 在实际操作中，如果借款人还款金额不足，贷款机构通常会通过短信、电话或邮件等方式提醒借款人补足还款金额。
- 如果借款人在规定时间内补足了还款金额，那么通常不会被视为逾期。
- 如果借款人未能在规定时间内补足还款金额，那么贷款机构可能会将其视为逾期，并采取相应的措施，如收取逾期费用、上报征信系统等。
法律建议：
- 仔细阅读贷款合同：借款人在签订贷款合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于还款金额、还款期限、逾期处理等方面的规定。
- 与贷款机构沟通：如果借款人对于还款金额有疑问或困难，应及时与贷款机构沟通，寻求解决方案。
- 保留还款证据：借款人在还款时，应保留好还款凭证，如转账记录、收据等，以备不时之需。
可能后果：
- 如果借款人还款金额不够且被视为逾期，可能会面临贷款机构收取逾期费用、罚息等额外费用。
- 逾期记录还可能被上报至征信系统，对借款人的信用记录造成不良影响。
- 在严重情况下，贷款机构甚至可能采取法律手段追讨欠款。
因此，建议您在还款前仔细核对还款金额，确保足够覆盖应还款项，以避免不必要的逾期和额外费用。如果您有任何疑问或困难，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。