结论：一方做了亲子鉴定且结果不匹配，在大多数情况下，可以较为确信地认为不是亲生的，但具体还需结合鉴定程序、样本来源等因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
亲子鉴定的科学性与法律效力
亲子鉴定是利用生物学和遗传学的手段来比对亲代与子代的遗传物质染色体上的DNA序列。当序列的同源性达到一定高度时，即可证明亲缘关系；反之，若序列差异显著，则可排除亲缘关系。从科学原理上讲，亲子鉴定结果具有较高的准确性，是判断亲子关系的重要依据。在法律上，亲子鉴定结果也具有相应的证明力，但并非绝对，还需结合其他证据和具体情况进行综合评估。
亲子鉴定结果的认定
- 鉴定程序合法：如果亲子鉴定是在合法、正规的鉴定机构进行，且鉴定程序符合相关规定，那么鉴定结果具有较高的可信度。在这种情况下，如果鉴定结果显示不匹配，即可以较为确信地认为不是亲生的。
- 样本来源可靠：亲子鉴定的样本来源也至关重要。如果样本来源可靠，如直接从被鉴定人身上采集的血液、毛发等，那么鉴定结果更具说服力。反之，如果样本来源存在问题，如样本被污染或混淆，那么鉴定结果可能不准确。
- 结合其他证据：虽然亲子鉴定结果具有较高的证明力，但在某些情况下，仍需结合其他证据进行综合判断。例如，在离婚诉讼中，如果男方有合理怀疑孩子非亲生，并提供了初步证据（如长期分居、妻子有出轨事实等），而女方拒绝进行亲子鉴定，那么法院可能会根据相关规定和证据情况，作出对女方不利的推定。然而，这种推定并非绝对，仍需结合其他证据进行综合评估。
特殊情况下的处理
- 拒绝亲子鉴定：如果一方拒绝进行亲子鉴定，法院将根据具体情况和法律规定作出判断。在民事诉讼中，如离婚诉讼中男方有合理怀疑孩子非亲生，并提供了初步证据，而女方拒绝进行亲子鉴定，法院可能会根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条的规定，作出对女方不利的推定，即认定孩子非男方亲生。但需要注意的是，这种推定并非绝对，仍需结合其他证据进行综合评估。
- 刑事诉讼中的情况：在刑事诉讼中，由于证明标准更为严格，法院一般不会仅因一方拒绝亲子鉴定就直接认定非亲生事实。刑事诉讼中的证据证明标准要求达到“事实清楚，证据确实、充分”，需要有更确凿的证据链条来认定亲子关系是否存在。
建议与注意事项
- 选择正规鉴定机构：在进行亲子鉴定时，应选择正规、合法的鉴定机构，确保鉴定程序的合法性和鉴定结果的准确性。
- 保护个人隐私：亲子鉴定涉及个人隐私，应妥善保管鉴定报告和相关证据，避免泄露给无关人员。
- 依法解决争议：在处理亲子关系争议时，应依法通过合理途径解决，尊重双方的意愿和权益，避免采取过激行为或非法手段。
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