针对您提出的“边界清楚而邻居不签字能确权登记吗”这一问题，我将结合相关流程和规定，为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，在不动产（包括宅基地）的确权登记过程中，四邻指界是一个重要的环节。这一环节的目的是确保不动产的边界清晰、无争议，从而保障登记的准确性和合法性。在四邻指界的过程中，通常需要相邻不动产的权利人亲自到场确认签字，以表示对边界的认可。
针对您的情况，如果边界已经清楚，但邻居不签字，这确实会给确权登记带来一定的困难。 不过，这并不意味着无法进行确权登记。以下是一些可能的解决路径：
再次协商：
- 您可以尝试与邻居进行进一步的沟通，解释确权登记的重要性和必要性，以及边界已经清楚的事实。
- 如果邻居有疑虑或担忧，您可以提出一些合理的解决方案，如共同委托第三方进行边界测量、签订书面协议明确边界等。
申请行政调解：
- 如果协商无果，您可以向村委会或乡镇人民政府申请行政调解。
- 行政调解过程中，相关部门会结合法律规定和村规民约为双方讲解利弊，促成双方达成一致。
- 调解成功后，双方可以签订调解协议，并作为确权登记的依据。
政府处理（行政裁决）：
- 如果行政调解仍然无法达成一致，您可以向乡级政府或县级自然资源主管部门申请处理。
- 政府处理程序包括申请、受理、调查、调解（再次尝试）和处理决定等步骤。
- 如果政府作出处理决定，且该决定具有法律效力，那么您可以依据该决定进行确权登记。
司法诉讼：
- 如果对政府的处理决定不服，或者争议涉及的是继承、买卖等民事法律关系，您可以向人民法院提起诉讼。
- 但需要注意的是，土地权属争议未经行政机关处理，直接向法院起诉的，法院可能不予受理。因此，行政处理通常是诉讼的前置程序。
在具体操作过程中，您还需要注意以下几点：
- 保留证据：无论是协商、调解还是诉讼过程中，您都需要保留好相关证据，如边界测量报告、协商记录、调解协议等。这些证据将有助于证明您的主张和权益。
- 遵守程序：在确权登记过程中，您需要严格遵守相关程序和规定。如涉及四邻指界环节，应确保相邻不动产的权利人亲自到场确认签字（如果邻居确实无法到场，可以尝试通过其他方式如远程视频等确认边界，但需符合相关规定）。
- 及时咨询：如果您在确权登记过程中遇到任何问题或困惑，可以及时咨询当地自然资源主管部门或相关法律专业人士的意见和建议。
综上所述，虽然邻居不签字会给确权登记带来一定的困难，但您仍然可以通过协商、行政调解、政府处理或司法诉讼等途径来解决争议并完成确权登记。希望这些解答和建议能对您有所帮助。