结论：诊所对公账户收款却不进入对公账户的行为，缺乏合法依据，且存在诸多法律风险，包括税务风险、行政处罚风险以及刑事法律风险等。以下为你详细分析：
法律依据
- 税收征收管理相关法律
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》规定，纳税人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实办理纳税申报，报送纳税申报表、财务会计报表以及税务机关根据实际需要要求纳税人报送的其他纳税资料。诊所作为纳税人，其经营收入应如实申报纳税。对公账户收款不进入对公账户，会导致收入记录不完整，无法准确核算应纳税额，违反了如实申报纳税的规定。
- 《中华人民共和国企业所得税法》要求企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。诊所通过非对公账户收款，隐瞒了部分收入，没有将全部收入纳入企业所得税的计税依据，属于偷逃税款的违法行为。
- 财务管理相关法规
- 《中华人民共和国会计法》规定，各单位必须依法设置会计账簿，并保证其真实、完整。单位负责人对本单位的会计工作和会计资料的真实性、完整性负责。诊所对公账户收款不进入对公账户，会使会计账簿记录不真实、不完整，无法准确反映诊所的经营状况和财务收支情况，违反了会计法的规定。
- 《人民币银行结算账户管理办法》明确，存款人使用银行结算账户，不得出租、出借银行结算账户，不得利用银行结算账户套取银行信用。诊所将本应进入对公账户的资金另行处理，可能涉及违反银行结算账户管理规定。
风险分析
- 税务风险
- 补缴税款及滞纳金：税务机关一旦查实诊所存在隐瞒收入、偷逃税款的行为，会要求诊所补缴少缴的税款，并按照规定加收滞纳金。滞纳金一般按日加收滞纳税款万分之五，这将增加诊所的经济负担。
- 罚款：根据税收征收管理法的规定，对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款。罚款金额可能相当可观，对诊所的经营造成严重影响。
- 刑事责任风险：如果诊所偷逃税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，构成逃税罪。根据刑法规定，可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
- 行政处罚风险
- 除了税务方面的行政处罚外，由于违反了会计法和银行结算账户管理办法等相关规定，财政部门和银行等监管机构也可能对诊所进行处罚。例如，财政部门可对诊所处以罚款，责令限期改正；银行可能会对诊所的银行结算账户进行限制，如暂停账户的非柜面业务、限制账户交易金额等，影响诊所的正常资金往来。
- 信用风险
- 诊所的违法行为会被记录在相关信用信息系统中，对其信用评级产生负面影响。这可能导致诊所在未来的经营活动中面临诸多限制，如难以获得银行贷款、在政府采购等活动中受到限制等，不利于诊所的长期发展。
- 民事纠纷风险
- 如果诊所与患者或其他合作伙伴之间因资金往来问题产生纠纷，由于资金未进入对公账户，可能导致财务记录混乱，难以证明资金的实际用途和归属，增加诊所的举证难度，使诊所在民事纠纷中处于不利地位，可能面临赔偿等法律责任。
如果诊所存在对公账户收款不进入对公账户的情况，建议尽快纠正，如实申报纳税，规范财务管理，以避免不必要的法律风险。要是你还有其他关于法律方面的问题，欢迎随时向我咨询。