购房合同丢失但按揭已办的情况下，仍可正常办理房本，具体流程及注意事项如下：

1. 合同补办或调档
   购房合同虽丢失，但开发商或房管部门通常留存有合同副本或电子档案。可联系开发商说明情况，申请补签合同或调取存档件（需核对原件与存档件一致性）。若开发商已注销或无法配合，可向当地房管部门申请调取合同备案信息，作为办理房本的依据。

2. 按揭银行配合
   按揭贷款已办理，说明银行已留存购房合同原件或复印件作为贷款审批材料。可联系贷款银行，申请出具《购房合同复印件加盖公章证明》或调取银行存档的合同副本，证明购房事实及贷款关系。部分银行可能要求签署《合同遗失声明》后提供材料。

3. 办理房本的具体流程

   • 准备材料：身份证、户口本、婚姻证明（如适用）、购房发票、契税完税证明、银行出具的贷款合同及还款证明、开发商提供的合同补办材料或房管部门调档证明。
     
   • 提交申请：向当地不动产登记中心提交材料，填写《不动产登记申请表》，并缴纳登记费。
     
   • 审核与领证：登记部门审核材料后，会出具《受理回执》，通常在5-30个工作日内完成制证，可凭回执领取房本。

4. 注意事项

   • 合同遗失声明：若需补签合同，建议与开发商共同签署《合同遗失声明》，明确原合同作废，避免后续纠纷。
     
   • 银行沟通：提前与贷款银行确认需提供的材料清单，避免因材料不全延误办理。
     
   • 代理办理：若本人无法到场，可委托他人代办，需提供公证委托书及受托人身份证。

总结：购房合同丢失不影响房本办理，关键是通过开发商、银行或房管部门调取合同相关证明材料，并配合贷款银行的要求完成流程。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询细节。