结论前置：驾驶机动车在以下多种情形下会被扣6分，这些情形主要涉及违反交通信号灯、超员超速、货车超载或违规载客、高速公路违规停车、违法占用应急车道、低能见度条件下不按规定行驶、违规运输超限或危险物品、以隐瞒欺骗手段补领驾驶证、疲劳驾驶、不按规定避让校车以及驾驶证被暂扣期间驾驶机动车等。

详细分析：

1. 违反交通信号灯通行：

   • 驾驶机动车不按交通信号灯指示通行，如闯红灯，这是严重违反交通秩序的行为，极易引发交通事故，因此会被扣6分。

2. 超员行驶：

   • 驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车载人超过核定人数未达20%的，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数20%以上的，超员会严重影响车辆的安全性能，增加事故风险，故扣6分。

3. 超速行驶：

   • 驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达20%的，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速20%以上未达到50%的，超速行驶会大大提高事故发生的概率，特别是重点车辆的管理更为严格，因此扣6分。

4. 货车超载或违规载客：

   • 驾驶货车载物超过核定载质量30%以上，或者货车违反规定载客的，这些行为会严重影响车辆的操控性和制动性能，危及乘客和道路安全，因此扣6分。

5. 高速公路违规停车与占用应急车道：

   • 驾驶营运客车以外的机动车在高速公路车道内停车，或者驾驶机动车在高速公路或城市快速路上违法占用应急车道行驶的，高速公路上停车和占用应急车道都是极其危险的行为，易引发严重交通事故，故扣6分。

6. 低能见度气象条件下不按规定行驶：

   • 在雾、雨、雪、沙尘、冰雹等低能见度气象条件下，驾驶机动车在高速公路上不按规定行驶的，如不开启雾灯、不保持安全车速和车距等，这些行为会大大增加事故风险，因此扣6分。

7. 违规运输超限或危险物品：

   • 驾驶机动车运载超限的不可解体的物品，未按指定的时间、路线、速度行驶或未悬挂明显标志的，或者驾驶机动车载运爆炸物品、易燃易爆化学物品及剧毒、放射性等危险物品，未按指定要求行驶或未采取必要安全措施的，这些行为对公共安全构成严重威胁，故扣6分。

8. 以隐瞒、欺骗手段补领机动车驾驶证：

   • 补领驾驶证应遵循诚实合法原则，隐瞒欺骗手段补领会破坏管理秩序，危害交通安全，因此扣6分。

9. 疲劳驾驶：

   • 连续驾驶中型以上载客汽车、危险物品运输车辆以外的机动车超过4小时未停车休息或停车休息时间少于20分钟的，疲劳驾驶会降低驾驶员的反应能力，增加事故风险，故扣6分。

10. 不按规定避让校车：

    • 校车是接送学生的专用车辆，不按规定避让会对学生生命安全构成威胁，因此扣6分。

11. 驾驶证被暂扣期间驾驶机动车：

    • 在驾驶证被暂扣期间仍驾驶机动车上路，属于严重违反交通法规的行为，扣6分。

总结与建议： 驾驶机动车时，应严格遵守交通法规，避免上述违法行为，以确保自身和他人的行车安全。扣分制度旨在通过惩罚性措施来强化驾驶人的安全意识，促进道路交通的和谐与安全。若您有任何关于交通运输领域的法律问题，如交通违章处理、交通事故赔偿等，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。