要使耕地赔偿款协议书受法律保护，需确保协议内容合法、条款完备、双方意思表示真实且程序合规，具体需注意以下几点：

1. 协议主体合法
   协议双方需具备完全民事行为能力，且为耕地合法权利人（如土地承包经营权人、所有权人）或其合法代理人。若涉及集体土地，需经村民会议或村民代表会议同意，并符合《农村土地承包法》相关规定。

2. 协议内容合法

   • 赔偿依据明确：需写明赔偿原因（如征收、占用、污染等），并引用具体法律依据（如《土地管理法》第48条关于征收补偿标准的规定）。
     
   • 赔偿范围清晰：包括土地补偿费、安置补助费、地上附着物及青苗补偿费等，各项金额需具体明确，避免模糊表述（如“合理补偿”）。
     
   • 禁止违法条款：不得约定“放弃诉讼权利”“排除法定补偿”等违反法律强制性规定的内容。

3. 程序合规

   • 协商过程透明：赔偿标准、金额需经双方充分协商，避免胁迫、欺诈或显失公平。若涉及集体土地，需履行民主议定程序（如公示、听证）。
     
   • 签字盖章完备：协议需双方签字（或盖章），并注明签订日期。若一方为法人，需加盖公章并由法定代表人或授权代表签字。
     
   • 见证或公证：可邀请基层组织（如村委会）见证，或对协议进行公证以增强证据效力。

4. 关键条款示例

   • 赔偿金额及支付方式：
     “甲方应于本协议签订后10日内，向乙方支付土地补偿费人民币XX万元、青苗补偿费XX万元，共计XX万元，支付方式为银行转账至乙方指定账户。”
     
   • 违约责任：
     “若甲方未按期支付赔偿款，每逾期一日，应按未支付金额的0.05%向乙方支付违约金。”
     
   • 争议解决：
     “因本协议产生的争议，双方应协商解决；协商不成的，任何一方可向耕地所在地人民法院提起诉讼。”

5. 注意事项

   • 避免口头协议：务必签订书面协议，口头约定难以举证。
     
   • 保留证据：协议签订前，留存土地权属证明（如承包合同、土地证）、赔偿依据（如征收公告、评估报告）等材料。
     
   • 及时履行：协议签订后，双方应按约定履行义务，避免因单方违约导致协议无效。

若需进一步审查或起草协议，可直接向我提供具体信息（如赔偿原因、金额、土地性质等），我将协助完善条款。