行政协议争议和行政侵权争议的异同可以归纳为以下几点：
相同点
主体特定性：
- 两者都涉及行政机关与行政相对人之间的关系。行政协议争议是行政机关与行政相对人之间因行政协议的签订、履行、变更或终止等产生的争议；行政侵权争议则是行政机关或其工作人员在行使行政职权过程中，因违法行为或不当行为侵犯行政相对人合法权益而产生的争议。
法律适用：
- 两者都可能涉及行政法律、法规以及民事法律的相关规定。在行政协议争议中，除了适用行政法律、法规外，还可能涉及合同法的相关规定；在行政侵权争议中，则主要适用行政法律、法规以及侵权责任法的相关规定。
救济途径：
- 两者都可以通过行政复议或行政诉讼等途径进行救济。行政相对人认为行政机关的行为侵犯其合法权益时，可以选择向行政复议机关申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼。
不同点
争议性质：
- 行政协议争议：主要围绕行政协议的签订、履行、变更或终止等产生的争议，属于合同性质的争议。它关注的是协议双方是否按照约定履行了各自的义务，以及因协议产生的权利义务关系。
- 行政侵权争议：则是因为行政机关或其工作人员的违法行为或不当行为侵犯了行政相对人的合法权益而产生的争议，属于侵权性质的争议。它关注的是行政机关的行为是否合法，以及是否对行政相对人造成了损害。
争议焦点：
- 行政协议争议：焦点通常在于协议的内容、履行情况、变更或终止的条件等。例如，行政相对人可能认为行政机关未按照协议约定履行义务，或者行政机关单方面变更或终止协议侵犯了其合法权益。
- 行政侵权争议：焦点则在于行政机关的行为是否合法，以及该行为是否对行政相对人造成了损害。例如，行政相对人可能认为行政机关的行政处罚决定违法，或者行政机关在执法过程中侵犯了其人身权或财产权。
法律后果：
- 行政协议争议：如果行政相对人胜诉，法院可能会判决行政机关继续履行协议、采取补救措施或者赔偿损失等。这些法律后果主要围绕协议的履行和赔偿进行。
- 行政侵权争议：如果行政相对人胜诉，法院可能会判决行政机关撤销或变更违法行政行为、赔偿损失或者恢复原状等。这些法律后果主要围绕行政行为的合法性和赔偿进行。
举例说明：
- 行政协议争议：假设政府与某企业签订了一份土地出让协议，约定企业支付土地出让金后，政府将土地使用权转让给企业。后来，政府以各种理由拒绝转让土地使用权，企业因此提起行政诉讼。这就是一个典型的行政协议争议案例。
- 行政侵权争议：假设某市民在街头正常行走时，被执法人员以“影响市容”为由强行带走并拘留。该市民认为执法人员的行为违法，侵犯了其人身自由权，因此提起行政诉讼。这就是一个典型的行政侵权争议案例。
总结与建议：
行政协议争议和行政侵权争议在主体特定性、法律适用和救济途径等方面存在相同点，但在争议性质、争议焦点和法律后果等方面存在显著差异。在处理这类争议时，建议行政相对人根据具体情况选择合适的救济途径，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。