在行政诉讼中，如果起诉后发现新的违法行为再起诉，确实会受到诉讼时效的限制。以下是对这一问题的详细分析：
一、直接起诉新违法行为的时效规定
根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，公民、法人或其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。这一规定同样适用于新发现的违法行为。也就是说，如果你在行政诉讼过程中发现了新的违法行为，并打算就此提起新的诉讼，那么你需要在知道或应当知道该违法行为之日起六个月内提出诉讼。
二、特殊情况下的时效处理
不知道行政行为内容时的时效规定：
- 如果你不知道行政机关作出的新违法行为内容，其起诉期限将从知道或应当知道该行政行为内容之日起计算。但同样地，涉及不动产的行政行为从作出之日起超过二十年、其他行政行为从作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院将不予受理。
行政机关未告知诉权或起诉期限时的时效处理：
- 如果行政机关在作出新违法行为时，未告知你诉权或起诉期限，起诉期限将从你知道或应当知道诉权或起诉期限之日起计算。但最长不得超过从知道或应当知道具体行政行为内容之日起的两年。
不可抗力或其他不属于当事人自身原因耽误起诉期限：
- 如果存在不可抗力或其他不属于你自身原因耽误了起诉期限的情况，被耽误的时间是不计算在起诉期限内的。这体现了法律的人文关怀和灵活性，确保了在特殊情况下你的合法权益仍然能够得到保障。
三、诉讼时效的连续性与中断
- 连续性：诉讼时效是连续计算的，一旦开始计算，除非有法定事由（如不可抗力等），否则不会中断或暂停。因此，你需要密切关注时效期限，确保在规定期限内提起诉讼。
- 中断：在行政诉讼中，诉讼时效的中断通常发生在提起诉讼、当事人一方提出要求或者同意履行义务等情形下。然而，对于新发现的违法行为提起诉讼，并不直接导致原诉讼时效的中断，而是需要按照新发现的违法行为的诉讼时效规定来重新计算。
四、法律建议
- 及时取证：在发现新违法行为后，应尽快收集相关证据，以证明该违法行为的存在以及你对其的知晓时间。
- 咨询专业律师：由于行政诉讼时效问题复杂且严格，建议在提起诉讼前咨询专业律师，以确保你的诉讼符合时效要求。
- 注意时效期限：密切关注时效期限，确保在规定期限内提起诉讼，以免因超过时效而丧失胜诉权。
总结来说，在行政诉讼中，如果起诉后发现新的违法行为再起诉，你需要根据新违法行为的性质以及你对其的知晓时间，按照相关法律规定来计算诉讼时效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。