同母异父的两兄弟去做母系亲缘鉴定结果不一样，这通常意味着在母系遗传标记上，两人的检测结果存在差异，这种情况可能由多种因素导致。以下从几个可能的角度进行分析：
遗传变异：
- 每个人的遗传信息都是独一无二的，即使是在同母异父的兄弟之间，也会因为父系遗传的不同以及基因突变等因素，导致在母系遗传标记上存在差异。这种差异是自然发生的，且在一定程度上是随机的。
检测误差：
- 亲缘鉴定虽然具有高度的准确性，但仍然存在一定的误差率。这种误差可能来源于样本采集、处理、分析等各个环节。例如，样本污染、实验操作不当、仪器故障等都可能导致检测结果出现偏差。
非生物学因素：
- 在极少数情况下，可能存在非生物学因素导致的鉴定结果不一致。比如，其中一方可能并非生物学上的兄弟，而是由于某种原因（如抱错、领养等）被误认为是兄弟。然而，这种情况在同母异父的兄弟中相对罕见。
针对这种情况，建议采取以下措施：
- 重新鉴定：如果初次鉴定结果存在疑问，可以考虑进行重新鉴定。选择一家具有资质、信誉良好的鉴定机构，确保样本采集、处理、分析等各个环节的规范性和准确性。
- 咨询专业人士：在重新鉴定之前或之后，可以咨询遗传学专家或律师，了解鉴定结果的可靠性和可能的原因，以及后续的法律行动建议。
- 考虑其他证据：如果鉴定结果对家庭关系产生重大影响，除了亲缘鉴定外，还可以考虑收集其他证据来支持或反驳鉴定结果，如家庭照片、视频、证人证言等。
最后需要强调的是，亲缘鉴定结果只是判断家庭关系的一种依据，并非绝对。在面对鉴定结果不一致的情况时，应保持冷静和理性，通过合法途径寻求解决方案。如果你有任何进一步的疑问或需要法律帮助，请随时向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律建议和支持。