结论：邻居在有争议的地方种树是否违法，需根据具体情况判断，主要涉及土地权属、相邻关系及地方性法规等因素。以下从不同角度详细分析：

1. 土地权属争议未解决时

若争议土地的权属尚未明确（如未取得土地使用权证或存在权属纠纷），邻居擅自种树可能构成对争议土地的“无权处分”或“侵权行为”。根据《民法典》第二百三十五条，无权占有不动产或动产的，权利人可以请求返还原物。此时：

• 若您是土地合法权利人：可要求邻居停止侵害、恢复原状（如移除树木），并赔偿损失（如树木根系破坏土地导致的损失）。
• 若双方均主张权属：需先通过行政确权（如向自然资源部门申请确权）或司法诉讼（如提起“物权确认纠纷”之诉）明确权属，再处理种树问题。

2. 土地权属明确，但种树行为违反相邻关系原则

即使土地权属无争议，邻居种树也可能因违反相邻关系原则而违法。根据《民法典》第二百八十八条至第二百九十六条，相邻权利人应遵循“有利生产、方便生活、团结互助、公平合理”的原则处理相邻关系。常见违法情形包括：

• 树木影响通风、采光或日照：若树木高度、密度导致您房屋采光不足（如低于当地《城市居住区规划设计标准》规定的日照时数），可要求邻居修剪或移除。
• 树木根系破坏您的土地或建筑物：若树木根系侵入您土地导致地面塌陷、管道破裂等，可要求邻居赔偿损失并恢复原状。
• 树木构成安全隐患：如树木倾斜、枯死可能倒塌伤人或损坏财物，可要求邻居采取加固措施或移除。

3. 违反地方性法规或小区管理规约

部分地区对树木种植有特殊规定，例如：

• 城市绿化条例：部分城市规定，在公共绿地或居民区种植树木需经城市绿化主管部门审批，擅自种植可能面临行政处罚（如罚款、责令移除）。
• 小区管理规约：若争议土地位于小区内，且小区规约明确禁止业主擅自种植树木，邻居行为可能违反规约，物业公司或业主委员会可要求其整改。

4. 特殊情形：历史遗留问题或善意占有

若邻居种树行为持续多年（如超过20年），且您未提出异议，可能构成“善意占有”或“时效取得”（需结合地方司法实践判断）。此时，您主张权利的难度会增加，但并非绝对无法维权。

法律建议

1. 收集证据：包括土地权属证明（如房产证、土地证）、争议土地现状照片/视频、邻居种树时间证据（如证人证言、监控录像）、树木影响生活的证据（如采光检测报告、房屋损坏鉴定报告）。
2. 协商或调解：优先通过居委会、物业公司或人民调解委员会协商解决，降低维权成本。
3. 行政投诉或诉讼：若协商无果，可向城市绿化主管部门投诉（如涉及违规种树），或向法院提起“相邻关系纠纷”之诉，要求邻居停止侵害、赔偿损失。

提示：法律问题需结合具体证据和地方规定判断，若争议复杂，建议直接向我咨询，我会根据您提供的细节进一步分析。