结论：未经批准用协议的方式把阳台改卧室变更房屋用途所签订的协议，其效力需根据具体情况判断，一般来说，若该变更违反了法律法规的强制性规定或损害了公共利益，则协议可能被认定为无效；若未违反相关规定且未损害公共利益，则协议可能有效，但可能面临行政处罚或需要恢复原状的风险。
分析说明：
协议效力的法律基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。若将阳台改卧室变更房屋用途的协议违反了这些规定，如违反了城市规划、建筑安全、消防安全等方面的法律法规，则该协议可能被认定为无效。
变更房屋用途的合法性：
- 房屋用途的变更通常需要经过相关部门的批准或备案。未经批准擅自变更房屋用途，不仅可能违反法律法规，还可能对房屋的结构安全、消防安全等造成隐患，损害公共利益。因此，即使双方签订了协议，若该变更未经批准，协议也可能因违法而无效。
协议可能面临的后果：
- 即使协议在双方之间被视为有效，但若该变更行为被相关部门发现，可能面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。此外，若因变更房屋用途导致他人损害，如影响邻居的采光、通风等，还可能承担民事赔偿责任。
特殊情况下的协议效力：
- 在某些特殊情况下，如变更房屋用途并未违反法律法规的强制性规定，且未损害公共利益，同时双方当事人在签订协议时均出于真实意思表示，且协议内容合法合规，则该协议可能被认定为有效。但即便如此，若相关部门要求恢复原状或进行其他处理，双方仍需遵守。
法律建议：
- 谨慎变更房屋用途：在变更房屋用途前，应充分了解相关法律法规和政策要求，确保变更行为合法合规。
- 咨询相关部门：在变更房屋用途前，建议咨询当地的城市规划、建设、消防等部门，了解变更的具体要求和流程。
- 签订合法协议：若双方确实需要签订变更房屋用途的协议，应确保协议内容合法合规，明确双方的权利和义务，以及违约责任等。
- 考虑法律后果：在签订协议前，应充分考虑变更房屋用途可能面临的法律后果，如行政处罚、民事赔偿等，并做好相应的准备。
行动建议：
- 若您已经签订了此类协议，且担心其效力问题，建议尽快咨询专业律师，对协议内容进行审查，并了解可能面临的法律后果。
- 若您正考虑变更房屋用途并签订相关协议，建议先咨询相关部门了解变更的具体要求和流程，再在律师的指导下签订合法合规的协议。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。