针对您提出的“两个电瓶车事故主次责任后自己承担了次要责任再去报医保的时候直系亲属是否可以”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在交通事故中，如果事故认定书已经明确了主次责任，并且您承担了次要责任，那么您自己承担的那部分医疗费用，在符合一定条件下，是有可能通过医保进行报销的。这一点，根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，是可以得到支持的。具体来说，有三种情况医保可以报销部分医疗费：
在交通事故中自己承担一部分责任：这种情况下，自己承担的医疗费可以在医保中报销。就您的情况而言，既然您承担了次要责任，那么您自己承担的那部分医疗费用，理论上是可以申请医保报销的。
医疗费用依法应当由第三人负担，但第三人不支付或者无法确认第三人：在这种情况下，基本医疗保险基金可以先行支付，之后有权向第三人追偿。不过，这一条款在您的情况中可能并不直接适用，因为对方（即主要责任方）是明确且可追偿的。
交通事故自己承担全部责任：这种情况下，因自己过错产生伤害所导致的医疗费用，不属于不纳入基本医疗保险基金支付范围的情形，医疗保险部门必须报销医疗费用。但这一条款显然不适用于您的情况，因为您并非承担全部责任。
接下来，关于您提到的“直系亲属是否可以代为报销”的问题，这通常取决于具体的医保政策和报销流程。在一般情况下，如果直系亲属（如配偶、父母、子女等）持有您的医保卡和相关医疗费用单据，并且符合医保报销的其他条件（如就诊医院、用药范围等），那么他们是有可能代为办理报销手续的。但具体是否可行，还需要您咨询当地的医保部门或相关机构，以获取最准确的信息。
此外，我还想提醒您的是，在申请医保报销时，一定要确保所有提供的单据和资料都是真实、完整且有效的。同时，也要了解并遵守当地的医保政策和报销流程，以免因不了解规定而导致报销失败或产生不必要的麻烦。
最后，如果您在申请医保报销过程中遇到任何问题或困难，都可以随时向当地的医保部门或相关机构寻求帮助和支持。他们将会为您提供专业的指导和帮助，确保您的权益得到保障。