结论：电动三轮车被查处是否会扣C1驾驶证的分，主要取决于该电动三轮车是否被认定为机动车以及具体的交通违法行为。

1. 电动三轮车的性质认定：

   • 根据相关规定，电动三轮车如果设计时速、空车质量、外形尺寸等符合机动车标准，或者经过鉴定属于机动车范畴的，那么驾驶该车辆就需要相应的机动车驾驶证。
   • 如果电动三轮车被认定为非机动车，那么通常不会直接扣C1驾驶证的分，但可能会因其他交通违法行为（如闯红灯、逆行等）受到相应的行政处罚。

2. 扣分情况分析：

   • 若电动三轮车被认定为机动车：
     • 如果驾驶人持有C1驾驶证但未取得相应机动车（如三轮摩托车）的驾驶资格，那么驾驶电动三轮车可能构成“驾驶与准驾车型不符的机动车”的违法行为，根据相关规定，这种违法行为会被扣9分，并可能面临罚款等处罚。
     • 如果驾驶人不仅持有C1驾驶证，还取得了三轮摩托车的驾驶资格，但存在其他交通违法行为（如超速、酒驾等），那么会根据具体违法行为扣相应的分数。
   • 若电动三轮车被认定为非机动车：
     • 一般情况下，非机动车的交通违法行为不会直接扣C1驾驶证的分。但是，如果驾驶人因非机动车交通违法行为被处以罚款等行政处罚，且该处罚与驾驶证有关联（如累计扣分达到一定标准影响驾驶证使用），则可能间接影响驾驶证的状态，但这并非直接扣C1驾驶证的分。

3. 法律建议：

   • 驾驶电动三轮车前，请务必了解当地对电动三轮车的性质认定标准，确保自己具备相应的驾驶资格。
   • 遵守交通规则，不闯红灯、不逆行、不超速等，以减少交通违法行为的发生。
   • 如果因电动三轮车被查处而面临扣分或罚款等处罚，请积极配合执法部门的工作，并按照要求接受处理。

举例说明：

• 假设某地区将电动三轮车认定为机动车，且驾驶人只持有C1驾驶证未取得三轮摩托车驾驶资格。如果驾驶人驾驶电动三轮车被查处，那么根据相关规定，可能会因“驾驶与准驾车型不符的机动车”被扣9分。
• 假设某地区将电动三轮车认定为非机动车，且驾驶人因闯红灯被查处。那么驾驶人可能会面临罚款等行政处罚，但通常不会直接扣C1驾驶证的分。

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