自然人和独资（这里主要指个人独资企业）在多个方面存在显著的区别，以下是对这两者的详细比较：
一、定义与性质
自然人：
- 自然人是指具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的个体。在商业活动中，自然人可以直接从事工商业经营，成为个体工商户，或者作为投资者投资设立企业。
个人独资企业：
- 个人独资企业是由一个自然人投资，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。它是一种企业组织形式，具有相对独立的法律地位，但并非法人。
二、投资主体
自然人：
- 自然人作为投资主体时，可以是任何具有完全民事行为能力的个体，他们可以直接以自己的名义进行投资，并承担相应的法律责任。
个人独资企业：
- 个人独资企业的投资主体仅限于一个自然人。这个自然人既是企业的所有者，也是企业的经营者，对企业债务承担无限责任。
三、法律地位与责任范围
自然人（作为个体工商户）：
- 自然人从事工商业经营，经依法登记，为个体工商户。个体工商户对其经营债务承担无限责任，个人经营的，以个人财产承担；家庭经营的，以家庭财产承担；无法区分的，以家庭财产承担。
个人独资企业：
- 个人独资企业虽然具有相对独立的法律地位，但并非法人。它以其投资人的个人财产对企业债务承担无限责任。这意味着，如果企业债务无法清偿，投资人的个人财产也将被用于偿债。
四、组织形式与运营方式
自然人（作为个体工商户）：
- 个体工商户通常规模较小，运营方式灵活，可以由个人或家庭直接经营。它们不需要建立复杂的组织结构或管理制度。
个人独资企业：
- 个人独资企业虽然也是由一个自然人投资设立，但通常需要建立一定的组织结构和管理制度，以适应企业运营的需要。它们可能拥有员工、分支机构等，需要更加规范的管理和运营。
五、纳税方式
自然人（作为个体工商户）：
- 个体工商户主要采用定额征收税款的方式，需按定额缴纳相应比例的税额。它们的纳税方式相对简单，不需要建立完善的财务制度。
个人独资企业：
- 个人独资企业则需要按照企业的实际收入进行纳税，通常采用定率和查账征收的方式。它们需要建立完善的财务制度，有健全的会计核算和账簿记录，并遵守税务法规。
六、关于“非自然人投资或控股的法人独资企业”
- 这类企业并非由自然人直接投资设立，而是由企业法人或事业单位法人等主体投资设立的公司。它们的投资主体、法律地位、责任范围等与个人独资企业存在显著差异。例如，法人独资企业的投资者是企业法人，它们具有独立的法人资格，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。
总结：自然人和独资（个人独资企业）在定义与性质、投资主体、法律地位与责任范围、组织形式与运营方式以及纳税方式等方面都存在显著差异。自然人可以直接从事工商业经营成为个体工商户，也可以作为投资者投资设立企业；而个人独资企业则是由一个自然人投资设立，以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。