结论：银行能否封农村自建房，取决于该房屋是否办理了抵押登记以及法院的最终判决。若房屋已抵押且未还款，银行在胜诉后可能申请法院查封；若未抵押，银行则无权直接查封，但可通过法律途径追讨债务。
详细分析：
房屋已办理抵押登记的情况：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果农村自建房已经办理了抵押登记，那么当债务人（即欠款人）未能按时偿还银行贷款时，银行作为抵押权人，有权依法行使抵押权。
- 法律程序：银行需要先向法院提起诉讼，要求债务人偿还贷款。如果法院判决债务人偿还贷款，而债务人仍未履行，银行可以申请法院强制执行，包括查封、拍卖抵押物（即农村自建房）以偿还贷款。
- 实际操作：在实际操作中，银行通常会先与债务人协商还款计划，如果协商无果，才会采取法律手段。因此，即使房屋已抵押，也不一定会立即被查封。
房屋未办理抵押登记的情况：
- 法律依据：如果农村自建房未办理抵押登记，那么银行作为债权人，无权直接查封该房屋。因为银行对该房屋没有抵押权，无法直接行使相关权利。
- 法律程序：银行仍然可以通过法律途径追讨债务，比如向法院提起诉讼，要求债务人偿还贷款。如果法院判决债务人偿还贷款，而债务人仍未履行，银行可以申请法院强制执行债务人的其他财产（如银行存款、车辆等），但无法直接查封未抵押的农村自建房。
- 特殊情况：如果债务人除了农村自建房外没有其他可供执行的财产，且该房屋是债务人生活所必需的居住房屋，那么根据相关法律规定，法院可能会考虑保护债务人的基本生活需求，而不对该房屋进行查封和拍卖。
建议与提醒：
- 及时沟通：如果您欠银行钱未还，建议及时与银行沟通，说明还款困难的原因，并尝试协商还款计划或延期还款等方案。
- 了解法律程序：了解相关的法律程序和规定，以便在面临法律纠纷时能够做出正确的应对。
- 保护自身权益：如果银行采取不当手段或侵犯您的合法权益，您可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
后续行动：
- 如果您对具体的法律程序或规定有疑问，或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供详细的法律解释和建议。