若税收保全措施期限已过三年，通常税收保全措施会因期限届满而自动解除，但需结合具体情况判断后续处理方式，以下分情况说明：

1. 税收保全措施自动解除后的常规处理
   根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十八条规定，税务机关采取税收保全措施的期限一般不得超过6个月；因重大案件需要延长的，应当报国家税务总局批准，但延长期限也不得超过6个月。若保全措施期限已超过法定最长期限（即超过1年），或虽未超期但已满3年（可能因程序瑕疵导致长期未处理），该措施会因期限届满而自动失效。此时纳税人可要求税务机关解除保全措施（如解封银行账户、返还查封财产等），若税务机关未主动解除，纳税人可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

2. 需关注是否存在“期限中断”或“重新启动”情形
   若在保全措施期限内，税务机关已依法启动税收强制执行程序（如拍卖查封财产抵缴税款），或纳税人与税务机关达成延期缴纳税款的协议，原保全措施的期限可能因程序转换或协议履行而中断或重新计算。例如，若税务机关在保全措施期限内将案件移送司法机关处理，或纳税人申请行政复议/诉讼导致程序暂停，可能影响期限计算。此时需结合具体程序节点判断保全措施是否仍有效。

3. 纳税人权利救济路径

   • 申请解除保全：若确认保全措施已因期限届满失效，纳税人可向税务机关提交书面申请，要求解除保全并返还财产或解除账户冻结。
     
   • 行政复议/诉讼：若税务机关拒绝解除，纳税人可在知道该行为之日起60日内申请行政复议，或在6个月内直接提起行政诉讼，主张保全措施违法并要求赔偿损失。
     
   • 国家赔偿申请：若因税务机关违法采取或超期维持保全措施导致财产损失，纳税人可依据《国家赔偿法》要求税务机关赔偿。

建议行动步骤：

1. 携带税收保全决定书、相关税款缴纳凭证等材料，向当地税务机关核实保全措施的当前状态（是否已解除、是否涉及后续程序）；
   
2. 若税务机关确认措施已失效但未解除，可书面催告其履行职责；
   
3. 若协商无果，及时启动行政复议或诉讼程序维护权益。
   

如有进一步细节（如保全措施类型、是否涉及税款争议等），可随时补充说明，我会为您细化分析。