结论：若黄金丢失40克已立案，后发现是家人拿走，撤案后是否发还“款”（此处应理解为黄金或其等价款项），需分情况讨论，一般若黄金仍在且未被损毁或变卖，会发还；若已被变卖等，可能发还变卖款项，但也存在复杂情况。以下是具体分析：
- 刑事立案与撤案的基本情况
- 当黄金丢失达到一定数额（40克黄金价值通常较高，可能达到刑事立案标准，具体需结合当地盗窃罪立案追诉标准判断），公安机关立案侦查，这是基于可能存在盗窃等刑事犯罪行为。
- 若后续查明是家人拿走，且不存在盗窃等犯罪故意（比如是误拿、临时借用未及时说明等情况），那么该案件就不符合盗窃罪等刑事犯罪的构成要件，公安机关会撤销案件。
- 撤案后财物发还情况
- 黄金仍在且未被损毁或变卖：如果家人拿走黄金后，黄金仍然完好存在，没有被损毁或者变卖。在这种情况下，公安机关在撤案后，应当将黄金发还给原所有权人，也就是丢失黄金的一方。因为此时黄金的物权并未发生实质性的转移和改变，只是暂时被家人占有，撤案后应恢复原状。
- 黄金已被变卖：要是家人已经将黄金变卖，那么情况会相对复杂一些。如果家人变卖黄金的行为是善意的（比如不知道该黄金属于非法获取，以合理价格卖给第三人），且第三人已经合法取得了黄金的所有权，那么原所有权人可能无法直接从第三人处要回黄金。此时，家人变卖黄金所得的款项，在撤案后，理论上应该发还给原所有权人。但如果家人在变卖过程中存在恶意（比如低价变卖等），可能涉及其他法律问题，原所有权人可以通过民事途径向家人主张赔偿损失等权利。
- 存在其他复杂情形：例如，在黄金丢失到立案侦查再到撤案这个过程中，如果因为黄金的丢失给原所有权人造成了其他间接损失（比如因为寻找黄金产生的合理费用等），这些损失的承担和发还问题，需要根据具体情况，通过协商或者民事诉讼等途径来解决，撤案本身并不直接涉及这些间接损失的发还。
如果遇到此类情况，建议及时与公安机关沟通，了解案件进展和财物处理情况，必要时可以寻求进一步的法律帮助以维护自身合法权益。