结论：国土局让在加油站旁边建厂房是否违法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断，包括加油站与厂房的距离、厂房的用途、是否符合相关规划和安全要求等。
分析：
加油站与厂房的安全距离：
- 根据《汽车加油加气站设计与施工规范》等相关规定，加油站与周边建筑（包括厂房）需要保持一定的安全距离，以确保在发生火灾、爆炸等事故时，不会对周边建筑和人员造成重大影响。
- 如果国土局允许建设的厂房与加油站的距离不符合这些安全规范，那么这种建设行为就可能是违法的。
厂房的用途与规划：
- 厂房的用途也是判断其是否合法建设的重要因素。如果厂房将用于存储易燃易爆物品或进行其他危险作业，那么其建设位置就需要更加谨慎考虑，以避免对加油站构成威胁。
- 同时，厂房的建设还需要符合当地的城乡规划和土地利用规划。如果国土局允许的建设行为违反了这些规划，那么也是违法的。
相关审批手续：
- 在建设厂房之前，通常需要办理一系列审批手续，包括土地使用审批、建设规划审批、消防安全审批等。
- 如果国土局允许建设的厂房没有取得这些必要的审批手续，或者审批手续存在瑕疵，那么这种建设行为同样可能是违法的。
建议：
- 核实安全距离：首先，需要核实加油站与拟建厂房之间的实际距离，并对比相关安全规范，确保符合安全要求。
- 了解厂房用途与规划：其次，需要了解厂房的具体用途和当地的城乡规划、土地利用规划，确保厂房的建设符合这些规划要求。
- 办理审批手续：在建设厂房之前，务必办理好所有必要的审批手续，包括土地使用审批、建设规划审批、消防安全审批等，以确保建设行为的合法性。
可能后果：
- 如果国土局允许在加油站旁边建设的厂房违反了相关安全规范、城乡规划或土地利用规划，或者没有取得必要的审批手续，那么这种建设行为可能会面临被责令停止建设、拆除或罚款等法律后果。
进一步思考：
- 在实际操作中，如果对于国土局允许的建设行为存在疑问或争议，建议及时咨询当地相关部门或专业律师，以获取更准确、更权威的法律意见。
- 同时，作为建设方或相关利益方，也应该积极了解并遵守相关法律法规和规划要求，以确保建设行为的合法性和安全性。
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