若持有商标注册证却被起诉商标侵权，可按以下步骤处理：

1. 核实起诉内容与自身商标权范围
   首先需仔细阅读起诉状，明确对方指控的具体侵权行为（如是否在相同/类似商品上使用了相同/近似商标），并核对自身商标注册证上的核定使用范围（商品/服务类别、商标图样等）。若自身商标注册在先且使用范围不超出核定类别，可初步判断对方指控可能不成立，但需进一步分析是否存在“商标无效”“权利冲突”等特殊情形。

2. 分析对方商标的权利状态与稳定性
   需调查对方商标的注册情况：

   • 若对方商标未注册或注册未完成（如处于异议期），其主张可能缺乏法律依据；
     
   • 若对方商标已注册，需核查其注册时间（是否晚于己方商标）、是否存在连续三年未使用等可撤销情形；
     
   • 若对方商标曾被宣告无效或处于无效宣告程序中，其权利基础可能存在瑕疵。
     可通过国家知识产权局商标局官网查询商标状态，或委托律师进行专业检索。

3. 评估自身使用行为的合法性
   即使持有商标注册证，若使用行为超出核定范围（如将注册在“服装”上的商标用于“食品”），或存在“恶意抢注”“傍名牌”等情形，仍可能构成侵权。需自查：

   • 是否在核定商品/服务上规范使用商标（包括图样、文字、颜色组合等）；
     
   • 是否将商标作为商品名称或装潢使用，导致混淆；
     
   • 是否存在“突出使用”“变形使用”等可能弱化商标显著性的行为。
     

4. 收集抗辩证据并制定诉讼策略
   根据侵权指控类型准备证据：

   • 不侵权抗辩：提供商标注册证、商品销售合同、宣传材料等，证明使用行为合法；
     
   • 在先权利抗辩：若己方商标使用在先，可主张对方商标抄袭或恶意注册；
     
   • 商标无效抗辩：若对方商标存在瑕疵，可同步向商标局提起无效宣告程序；
     
   • 合理使用抗辩：若使用对方商标属于描述性使用（如“兼容XX品牌配件”），需证明无主观恶意且未导致混淆。
     

5. 积极应诉或协商和解

   • 若证据充分，可委托律师提交答辩状，参与庭审辩论；
     
   • 若侵权风险较高，可考虑与对方协商和解（如停止使用、支付许可费等），但需谨慎评估和解条款的法律后果。
     

提示：商标侵权诉讼涉及复杂的事实认定与法律适用（如《商标法》第57条、第59条），建议委托专业律师协助处理，避免因程序瑕疵或证据不足导致败诉。若有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。