结论前置：农村高压线从房屋头上过是否合法，需根据具体情况判断，关键在于是否经过合法审批、是否符合规划要求、是否侵犯居民权益以及是否满足安全距离等法规规定。以下从多个角度为您详细分析：
一、电力设施建设相关规定与审批程序
符合规划和审批则合法：
- 电力设施的建设，包括高压线的架设，需经过相关部门的规划和审批，如取得规划许可、建设许可等审批文件。若高压线的架设是按照法定程序进行，且符合电力行业的设计规范和安全标准，则通常认为是合法的。
违反规划和审批则违法：
- 若高压线的架设未经合法审批或不符合规划要求，如擅自改变既定线路，则构成违法行为。这种情况下，居民有权向相关部门投诉，要求停止违法行为并恢复原状。
二、对居民权益的影响与保障
未侵犯居民权益则不违法：
- 若高压线的架设虽从房屋上方经过，但未对居民的生命、财产安全及正常生活造成实质性不良影响，且采取了相应的安全防护措施，如设置警示标志、定期巡检等，则一般不认为违法。
侵犯居民权益则可能违法：
- 若高压线的架设导致安全隐患，如距离过近可能引发触电、火灾等风险，或产生电磁辐射等影响居民健康，则居民有权主张权利，要求消除影响或给予合理补偿。在这种情况下，如果电力部门未能妥善解决问题，其行为可能被认定为违法。
三、法规依据与安全距离
《电力设施保护条例》规定：
- 架空电力线路保护区有具体的安全距离规定，这些距离根据电压等级的不同而有所差异。例如，1~10千伏为5米，35~110千伏为10米等。这些规定旨在确保电力设施的安全运行和周边居民的生命财产安全。
- 架空电力线路一般不得跨越房屋，对于通道内的原有房屋，建设单位应与房屋产权所有者协商搬迁。在特殊情况下，如需跨越房屋，设计建设单位应采取增加杆塔高度、缩短档距等安全措施，并确保被跨越房屋的安全。
合法性判断：
- 若高压线从房屋上方通过且符合安全距离规定，并采取了必要的安全措施，则可能是合法的，但这种情况较为特殊且罕见。
- 在大多数情况下，高压线从房屋上方通过会违反上述法规中关于不得跨越房屋的规定，因此构成违法行为。
四、房屋所有者的权益保障与补偿
- 若因高压线通过房屋上方导致房屋所有者权益受损，如房屋价值降低、居住安全受威胁等，房屋所有者可以依法维权。
- 根据相关法律法规，房屋所有者可以要求相关部门进行合理的补偿，包括但不限于房屋价值降低的补偿、搬迁费用等。
五、实际操作建议
- 与相关部门沟通：若发现高压线从房屋上方通过，首先应与当地电力部门或规划部门沟通，了解高压线的架设是否经过合法审批，并要求其出示相关审批文件。
- 评估安全风险：若怀疑高压线架设存在安全隐患或电磁辐射问题，可以委托专业机构进行评估，并根据评估结果采取相应的措施。
- 依法维权：若确认高压线架设违法或侵犯自身权益，可以依法向相关部门投诉或提起诉讼，要求停止违法行为、消除影响并给予合理补偿。
总结：农村高压线从房屋头上过是否合法，需综合考虑多个因素。在遇到此类情况时，建议房屋所有者及时与相关部门或电力建设企业沟通协商，确保自身权益得到保障。同时，相关部门也应加强监管和审批力度，确保电力设施建设的合法性和安全性。如果您有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。