结论：耕地打木桩是否违法及如何处理，需根据具体情况判断，包括是否改变土地用途、是否获得相关部门批准等因素。以下从不同角度进行分析：

一、是否改变土地用途

1. 若未改变土地用途：

   • 如果在耕地上打木桩是为了进行正常的农业生产活动，如搭建临时农业设施、固定农作物等，且未对土地造成永久性损害，也未改变土地的农业用途，那么这种行为通常不构成违法。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，土地使用者应当按照土地利用总体规划确定的用途使用土地。若未改变用途，则符合法律规定。

2. 若改变土地用途：

   • 如果在耕地上打木桩是为了建设永久性建筑、进行非农业开发等，改变了土地的农业用途，那么这种行为可能构成违法。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第七十五条：“违反本法规定，占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的，或者因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化的，由县级以上人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门等按照职责责令限期改正或者治理，可以并处罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。”

二、是否获得相关部门批准

1. 若获得批准：

   • 如果在耕地上打木桩的行为已经获得了当地自然资源、农业农村等相关部门的批准，且符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定，那么这种行为是合法的。
   • 建议：在进行此类活动前，应咨询并获得相关部门的批准，以确保行为的合法性。

2. 若未获得批准：

   • 如果在耕地上打木桩的行为未经相关部门批准，即使未改变土地用途，也可能因违反土地管理程序而面临处罚。
   • 处理方式：一旦发现未经批准在耕地上打木桩的行为，相关部门可能会责令停止违法行为、限期改正或者治理，并可能处以罚款。

三、具体处理方式

1. 对于合法行为：

   • 如果打木桩的行为合法，无需特殊处理，但应确保后续使用符合土地利用规划和相关法律法规的规定。

2. 对于违法行为：

   • 责令停止：相关部门会责令停止在耕地上打木桩的行为，并要求恢复土地原状。
   • 限期改正：如果土地已经受到一定程度的损害，相关部门会要求限期改正或者治理，以恢复土地的种植条件。
   • 罚款：根据违法行为的严重程度和造成的后果，相关部门可能会处以罚款。
   • 刑事责任：如果违法行为构成犯罪，如非法占用农用地罪等，将依法追究刑事责任。

进一步建议：如果您在耕地上打木桩的行为存在疑问或面临处罚，建议及时咨询当地自然资源、农业农村等相关部门，了解具体政策和法规要求，并积极配合相关部门的调查和处理工作。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。