正在打官司的店铺被强拆，是可以立案的。不过，具体能否立案以及立案后的处理结果，还需要根据强拆的性质、原因以及相关法律法规来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：
一、强拆的性质与立案可能性
违法强拆：
- 如果强拆行为未经法定程序，未取得合法的拆迁许可，或者拆迁过程中存在暴力、威胁等非法手段，那么这种强拆就是违法的。
- 在这种情况下，你可以向公安机关报案，要求立案侦查。公安机关有义务对违法强拆行为进行调查，并依法追究相关责任人的法律责任。
合法强拆但程序违法：
- 即使强拆行为本身是基于合法的拆迁决定，但如果拆迁过程中未按照法定程序进行，如未提前通知、未给予合理补偿等，也可能构成程序违法。
- 在这种情况下，你同样可以向相关部门投诉或报案，要求纠正违法行为，并可能通过法律途径寻求赔偿。
二、立案后的处理流程
刑事立案：
- 如果强拆行为涉嫌犯罪，如故意毁坏财物罪、非法侵入住宅罪等，公安机关会依法进行刑事立案侦查。
- 侦查过程中，公安机关会收集证据、查明事实，并可能对犯罪嫌疑人采取强制措施。
行政立案与复议/诉讼：
- 如果强拆行为属于行政行为，且你认为该行为违法或不当，你可以向相关行政部门提出行政复议申请，或者向人民法院提起行政诉讼。
- 在行政复议或诉讼过程中，你需要提供证据证明强拆行为的违法性，并要求相关部门撤销或变更原行政行为，或者赔偿你的损失。
三、法律建议与注意事项
及时收集证据：
- 在强拆发生后，你要尽快收集相关证据，如现场照片、视频、证人证言等，以证明强拆行为的存在和违法性。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但为保持回答完整性仍列出，实际回答中可侧重于“向我咨询”）：
- 拆迁安置和土地纠纷领域涉及复杂的法律法规和程序，建议你向我咨询，以便更好地了解你的权利和义务，以及如何通过法律途径维护自己的合法权益。
保持冷静与理性：
- 在处理强拆纠纷时，你要保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击，以免加剧矛盾或影响案件处理结果。
关注案件进展：
- 立案后，你要密切关注案件的进展情况，及时与相关部门或法院沟通，了解案件的处理进度和结果。
最后，我想强调的是，每个案件都有其独特性和复杂性，因此以上分析仅供参考。如果你正在面临店铺被强拆的问题，并且正在打官司，我建议你尽快向我咨询，以便我能根据你的具体情况为你提供更详细、更专业的法律建议。