针对您提出的“司机驾驶违规改装的客车怎么处罚”这一问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。
首先，需要明确的是，客车非法改装是严重违反道路交通安全法规的行为，它不仅会带来安全隐患，还将面临严厉的法律处罚。客车非法改装主要包括外观及结构改装（如改变车身颜色、更换发动机、车身或车架，擅自加高、加宽、加长等）和动力及电气系统改装（如更换大功率发动机、改变车辆原有的电气线路等）。
一、道路交通安全方面的处罚
根据《中华人民共和国道路交通安全法》：
- 禁止拼装机动车或擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。
- 驾驶非法改装的机动车上路行驶，公安机关交通管理部门将扣留车辆，收缴非法装置，责令恢复原状，并处二百元以上二千元以下罚款。
- 若驾驶拼装的机动车或已达到报废标准的机动车上路，还将被吊销机动车驾驶证，并强制报废车辆。
根据《机动车登记规定》：
- 擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据的，由公安机关交通管理部门责令恢复原状，并处警告或五百元以下罚款。
驾驶证扣分：
- 虽然具体扣分条款可能因地区和具体改装情况而异，但一般来说，驾驶擅自改变已登记的结构、构造或者特征的车辆上道路行驶的，会面临驾驶证扣分的处罚。对于客车而言，这一规定同样适用，具体扣分标准需依据当地交管部门执行。
二、非法改装营运车辆的额外处罚
如果客车是营运车辆，那么除了上述道路交通安全方面的处罚外，还将面临交通运输法规的额外处罚：
- 根据《中华人民共和国道路运输条例》：
- 对于从事道路运输经营活动的非法改装客车，县级以上道路运输管理机构将责令改正，并处以一千元以上五千元以下的罚款。
- 若擅自改装已取得车辆营运证的车辆，罚款金额将提高至五千元以上两万元以下。
三、非法改装的后果与警示
- 法律责任：非法改装车辆若发生交通事故，车主或驾驶员可能需承担更重的法律责任和经济赔偿。
- 信誉损失：对于客运企业而言，非法改装还会严重影响其信誉和经营发展，可能导致信誉降级或其他行政处罚。
- 安全风险：非法改装会破坏车辆的原有安全性能，增加交通事故的风险，对乘客和驾驶员的生命安全构成严重威胁。
四、建议与合规指导
为了避免非法改装带来的法律风险和安全隐患，我强烈建议车主和客运企业：
- 严格遵守国家法律法规，不进行任何形式的非法改装。
- 定期对车辆进行维护和检测，确保车辆的安全性能符合标准要求。
- 加强员工的安全教育和培训，提高安全意识。
- 对于有改装需求的情况，应咨询专业机构并依法办理相关手续。
综上所述，司机驾驶违规改装的客车将面临严厉的法律处罚，包括罚款、扣留车辆、吊销驾驶证等。为了您和他人的安全，请务必遵守相关法律法规，确保车辆的安全性和合法性。