小公司卖假仪器是违法的，且可能面临多方面的法律责任。以下是对此问题的详细分析：
一、行政责任
销售假冒伪劣产品的处罚：
- 根据《中华人民共和国产品质量法》的相关规定，销售者销售假冒伪劣产品的，由市场监督管理部门责令停止销售，没收违法销售的产品，并处违法销售产品货值金额等值以上三倍以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，吊销营业执照。
- 这意味着，如果小公司销售假仪器，一旦被发现，将面临严厉的行政处罚，包括高额罚款和可能的营业执照吊销。
对直接负责的主管人员和其他直接责任人员的处罚：
- 除了对公司本身的处罚外，市场监督管理部门还可以对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以罚款，罚款额度根据违法情节的严重程度而定。
二、刑事责任
生产、销售伪劣产品罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百四十条的规定，生产者、销售者在产品中掺杂、掺假，以假充真，以次充好或者以不合格产品冒充合格产品，销售金额较大的，构成生产、销售伪劣产品罪。
- 如果小公司销售的假仪器属于伪劣产品，且销售金额达到一定标准（如五万元以上），那么相关责任人将构成此罪，面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役和罚金等。
其他可能的犯罪：
- 如果小公司销售的假仪器涉及特定领域（如医疗、食品等），且造成了严重后果（如人员伤亡、财产损失等），那么相关责任人还可能构成其他犯罪，如生产、销售不符合安全标准的食品罪、生产、销售不符合标准的医用器材罪等。
三、民事责任
合同无效与赔偿：
- 如果小公司销售假仪器后，与购买方签订了合同并进行了经济往来，那么该合同可能因欺诈而被视为无效。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同无效后，行为人需返还因合同取得的财产，不能返还的应折价补偿，并有过错的一方需赔偿对方因此遭受的损失。
对第三方的赔偿责任：
- 如果小公司销售假仪器的行为导致了第三方（如消费者、合作伙伴等）的损失，那么相关责任人还需承担对第三方的赔偿责任。
- 这种赔偿责任可能包括合同违约赔偿、侵权责任赔偿等，具体取决于第三方的损失情况和相关责任人的过错程度。
四、建议与措施
立即停止销售假仪器：
- 如果小公司已经或正在销售假仪器，应立即停止此类行为，以避免进一步的法律责任和损失。
积极配合调查与处理：
- 如果市场监督管理部门或其他相关部门已经介入调查，小公司应积极配合，提供必要的证据和信息，以减轻或避免法律责任。
加强内部管理与培训：
- 小公司应加强内部管理，确保产品质量符合相关标准和要求。同时，对员工进行相关法律法规和职业道德的培训，提高员工的法律意识和诚信意识。
寻求法律帮助：
- 如果小公司面临法律纠纷或处罚，应及时寻求法律帮助，咨询专业律师的意见和建议，以维护自身的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国产品质量法》第四十九条、第五十条
- 《中华人民共和国刑法》第一百四十条、第一百四十三条、第一百四十五条
- 《中华人民共和国民法典》第一百五十七条
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