针对“二人公司退股东但法人失踪”的情况，以下是分步骤的解决方案：

1. 确认法人失踪的法律状态
   首先需明确“法人失踪”的具体含义。若法人代表（即法定代表人）仅是暂时失联（如联系不上但未被宣告失踪/死亡），公司仍可通过其他途径处理股东退出；若法人代表已被法院宣告失踪或死亡，则需依据《民法典》相关规定进入财产代管或继承程序，此时公司决策可能需由代管人或继承人参与。

2. 股东退出的法律路径
   根据《公司法》第71-74条，股东退出主要有以下方式：

   • 股权转让：若另一股东愿意受让股权，可直接签订转让协议并办理工商变更登记。若法人代表失联不影响另一股东的决策权（如公司章程无特殊约定），此路径仍可行。
     
   • 异议股东回购请求权：若符合《公司法》第74条情形（如公司连续五年不分红、合并分立等），股东可要求公司回购其股权，但需法人代表或公司配合办理手续。若法人失踪，此路径可能受阻。
     
   • 公司减资或解散：若股东无法通过转让或回购退出，可提议公司减资（需代表三分之二以上表决权的股东通过）或解散（需全体股东同意）。但法人代表失联可能导致决议无法签署，需通过诉讼解决。

3. 法人失踪时的替代决策机制

   • 临时负责人指定：若法人代表失联但公司仍需运营，可依据公司章程或股东会决议指定临时负责人（如另一股东或高管）代行职责，但需确保程序合法（如召开股东会并留存会议记录）。
     
   • 申请法院指定财产代管人：若法人代表被宣告失踪，其财产（包括公司股权）由代管人管理。股东可与代管人协商股权转让或回购事宜。
     
   • 诉讼强制解散：若公司陷入僵局（如股东会无法召开、经营严重困难），另一股东可依据《公司法》第182条向法院申请解散公司，但需证明“公司经营管理发生严重困难”且“通过其他途径不能解决”。

4. 实务操作建议

   • 收集证据：保留法人代表失联的证据（如报警记录、通讯记录、公告等），以及股东会决议、股权转让协议等文件。
     
   • 协商优先：尝试与法人代表的家属或关联方沟通，争取其配合办理手续。
     
   • 诉讼准备：若协商无果，可向法院提起股东资格确认之诉或公司解散之诉，并申请公告送达（若法人代表下落不明）。
     
   • 工商变更：完成股权转让或公司解散后，及时办理工商变更或注销登记，避免后续风险。

总结：法人失踪不影响股东通过合法途径退出，但需根据具体情况选择股权转让、回购、减资或解散等路径，并可能需通过指定临时负责人、财产代管人或诉讼等方式突破决策僵局。建议结合公司章程、股东协议及实际经营情况制定方案，必要时委托律师协助处理程序性事务。