针对施工单位工期延误及质量问题对甲方造成的间接损失如何索赔的问题，以下是我的详细解答：
明确索赔依据：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，施工单位因自身原因导致工期延误或质量问题，给甲方造成损失的，应当承担赔偿责任。特别是第五百七十七条明确规定了违约方应承担赔偿损失等违约责任。
- 合同条款：首先，应详细审查工程合同中关于工期延误和质量问题的具体条款，包括违约责任、赔偿范围及计算方式等。合同是双方权利义务的基础，也是索赔的重要依据。
确定间接损失范围：
- 间接损失定义：间接损失是指因工期延误或质量问题而导致的甲方预期利益损失、管理费用增加等非直接经济损失。
- 常见间接损失：
- 利润损失：因工期延误导致甲方无法按时投入使用或销售，从而错失的市场机会和预期利润。
- 管理费用增加：因工期延长，甲方需要增加的管理人员工资、办公费用等。
- 融资成本增加：若甲方为项目融资，工期延误可能导致融资期限延长，从而增加融资成本。
- 其他损失：如因质量问题导致的修复费用、第三方索赔等。
索赔程序与注意事项：
- 及时通知：甲方在发现施工单位工期延误或质量问题后，应及时书面通知施工单位，说明情况、影响及预计损失。
- 收集证据：甲方应收集并保留与间接损失相关的所有证据，如财务报表、市场分析报告、合同文件、沟通记录等。这些证据将作为索赔的重要依据。
- 协商与调解：在正式索赔前，甲方可以尝试与施工单位进行友好协商或调解，寻求双方都能接受的解决方案。
- 提交索赔申请：若协商无果，甲方应按照合同中的索赔程序提交正式的索赔申请，详细列明赔偿项目、金额及计算依据，并附上相关证据材料。
- 法律途径：若施工单位拒绝赔偿或双方无法达成一致，甲方可以考虑通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
具体索赔策略：
- 针对工期延误：甲方可以要求施工单位赔偿因工期延误导致的利润损失、管理费用增加等间接损失。同时，甲方还可以根据合同约定要求施工单位支付违约金（如果合同中有相关规定）。
- 针对质量问题：甲方可以要求施工单位承担修复费用、因质量问题导致的第三方索赔等直接损失，以及因质量问题导致的利润损失、市场声誉损害等间接损失。在索赔时，甲方应提供充分的证据证明质量问题与施工单位之间的因果关系。
风险提示：
- 证据充分性：间接损失的计算相对复杂，且需要充分的证据支持。因此，甲方在索赔前应确保已收集到足够的证据来证明其损失。
- 合同条款明确性：合同中关于工期延误和质量问题的条款应尽可能明确具体，以便在索赔时有据可依。如果合同条款模糊或存在争议，甲方应及时寻求专业律师的帮助进行解释和澄清。
总结与建议：针对施工单位工期延误及质量问题对甲方造成的间接损失索赔问题，甲方应首先明确索赔依据和间接损失范围，然后按照合同约定的索赔程序进行索赔。在索赔过程中，甲方应注重证据的收集和保留，并尝试与施工单位进行友好协商或调解。若协商无果，甲方应及时考虑通过法律途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。