关于您提出的“合同能制定罚款吗”这一问题，首先需要明确的是，在我国法律体系中，合同中通常不直接使用“罚款”这一表述，而是采用“违约金”来约定违约责任。接下来，我将从法律基础、合法性分析以及实践建议三个方面，为您详细解答这一问题。
一、法律基础
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以在合同中约定一方违约时应当支付一定数额的违约金，或者约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。违约金是对违约行为的一种经济制裁，其目的在于保证合同的顺利履行，并补偿因违约给对方造成的损失。
二、合法性分析
商事合同中的违约金条款：
- 在商事合同中，双方基于自愿原则约定的违约责任条款（即违约金），只要不违反法律法规的强制性规定，且金额设定合理（通常与违约造成的损失大致相当），即为合法有效。
- 例如，在建筑工程施工合同中，约定施工方逾期完工需支付一定金额的违约金，这样的约定在符合法律规定及合理性要求时，对双方均具有约束力。
劳动合同中的处罚措施：
- 在劳动合同关系中，用人单位虽然可以依法制定规章制度，对劳动者的违纪行为设定处罚措施，但这里的“罚款”必须严格遵循法律规定，且需经过公示并告知全体员工。
- 需要注意的是，劳动合同中的“罚款”与商事合同中的“违约金”在性质上有所不同，前者更多是基于用人单位的管理权，而后者则是基于合同双方的约定。
非行政主体的“罚款”无效：
- 罚款作为行政处罚措施，仅由法律、法规授权的行政主体实施。非行政主体（如行业协会、普通企业等）在合同中设定的具有行政管理性质的“罚款”条款，因缺乏法定处罚权而无效。
违约金数额的合理性：
- 违约金的数额应体现公平原则，与违约造成的实际损失大致相当。过高或过低的违约金均可能被视为不合理，进而影响其法律效力。
- 例如，如果租赁合同中约定承租方逾期支付租金需支付高额违约金（如全年租金的50%），这样的约定可能显失公平，承租方有权请求法院或仲裁机构进行调整。
三、实践建议
- 明确约定：在签订合同时，双方应详细约定违约金的计算方法和标准，避免使用“罚款”等可能引发混淆的表述。
- 区分概念：明确违约金与罚款的区别，确保合同条款的合法性和有效性。
- 合理设定：违约金的数额应基于双方的真实意愿和违约可能造成的实际损失进行合理设定，避免过高或过低。
- 咨询专业律师：如遇合同纠纷或争议，建议及时咨询专业律师以获取具体的法律意见和帮助。
综上所述，合同中可以约定违约金作为违约责任的承担方式，但应避免使用“罚款”这一表述，并确保违约金的设定合法、合理且符合双方的真实意愿。