对帐单上盖合同章，在法院起诉时通常是有效的，但具体效力需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、合同章的法律效力

合同章是单位对外签订合同时使用的专用印章，在法律上具有一定的效力。当对帐单上加盖了合同章，这通常意味着单位认可了对帐单上的内容，愿意承担相应的法律责任。因此，从印章的效力角度来看，对帐单上盖合同章是具有法律效力的。

二、对帐单作为证据的有效性

在诉讼中，对帐单可以作为证明双方交易关系、欠款金额等事实的证据。如果对帐单上加盖了合同章，这进一步增强了其作为证据的证明力。因为合同章的使用通常意味着单位对帐单内容的确认和认可，使得对帐单在诉讼中更容易被法院采纳为有效证据。

三、可能影响对帐单效力的因素

尽管对帐单上盖合同章通常具有法律效力，但也可能存在一些影响其效力的因素，包括但不限于：

1. 印章的真实性：如果合同章是伪造的或者被盗用的，那么对帐单的效力可能会受到质疑。在这种情况下，需要证明印章的真实性以及使用印章的合法性。
2. 对帐单内容的真实性：即使对帐单上加盖了合同章，如果其内容存在虚假或者误导性信息，那么其效力也可能会受到影响。因此，在诉讼中，需要对帐单内容的真实性进行举证和质证。
3. 诉讼时效：根据相关法律规定，诉讼时效是限制当事人行使诉讼权利的时间期限。如果对帐单所涉及的债权已经超过了诉讼时效期间，那么即使对帐单上加盖了合同章，也可能无法得到法院的支持。

四、法律建议

1. 确保印章的真实性：在使用合同章时，应确保印章的真实性和合法性，避免使用伪造或者被盗用的印章。
2. 保留相关证据：除了对帐单外，还应保留与交易相关的其他证据，如合同、发货单、收货单等，以便在诉讼中提供充分的证据支持。
3. 注意诉讼时效：应及时行使诉讼权利，避免超过诉讼时效期间导致债权无法得到保护。

总结来说，对帐单上盖合同章在法院起诉时通常是有效的，但具体效力需结合印章的真实性、对帐单内容的真实性以及诉讼时效等因素进行综合判断。如果你面临相关纠纷，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。