土地征收后，农业农村部门的管理权限会发生变化，但并非完全丧失管理权，具体情况需根据征收后的土地用途和相关法律规定来判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 土地征收后的性质变化：

   • 土地征收通常意味着土地从集体所有转变为国家所有，或者从一种用途（如农业用地）转变为另一种用途（如建设用地）。这一转变会直接影响相关部门的管理权限。
   • 如果土地被征收后用于非农业建设（如城市扩张、工业用地等），那么农业农村部门对该土地的管理权将大大减弱或丧失，因为此时土地已不再属于农业用地范畴。

2. 农业农村部门的管理范围：

   • 农业农村部门主要负责农业、农村和农民相关事务的管理，包括农业用地保护、农业生产经营、农村土地承包经营等。
   • 在土地征收后，如果土地仍然保留或部分保留农业用途（如征收后用于农业园区建设、生态农业等），农业农村部门可能仍会保留一定的管理权，但具体权限需根据征收协议和当地政策来确定。

3. 相关法律法规的依据：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，土地征收需经过法定程序，并明确征收后的土地用途。
   • 如果征收后的土地用途涉及农业，那么农业农村部门可能仍需参与管理，以确保农业用地的合理利用和保护。
   • 同时，征收后的土地管理还可能涉及自然资源、规划、建设等多个部门，农业农村部门需与其他部门协同工作。

4. 实际案例与操作：

   • 在实际操作中，土地征收后的管理权限划分往往取决于当地政府的规划和政策。
   • 例如，在某些地区，即使土地被征收用于建设，政府也可能保留部分农业用地作为生态保护区或农业示范区，此时农业农村部门仍会保留一定的管理权。
   • 另外，如果征收后的土地用于农村集体经营性建设用地入市等改革试点项目，农业农村部门也可能在特定范围内保留管理权。

建议：

• 如果您面临土地征收问题，并关心农业农村部门的管理权限，建议首先了解征收后的土地用途和当地政策。
• 您可以咨询当地农业农村部门或自然资源部门，以获取更具体的信息和指导。
• 如果您认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。