可以起诉，但能否胜诉需结合具体情况判断，主要涉及诉讼时效和证据问题。以下从不同角度为您详细分析：
一、诉讼时效问题
一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 在您的情况下，40年后才知道权益被侵犯，如果从知道或应当知道之日起算，可能已经超过了三年的诉讼时效。但这里存在一个关键点，即“知道或应当知道”的起算时间。
最长诉讼时效：
- 同样根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
- 您的案例中，虽然从征地发生到现在已经40年，但如果存在特殊情况（如一直不知情、村委会故意隐瞒等），您可以向人民法院申请延长诉讼时效。
二、证据问题
征地补偿协议的获取：
- 村委会不公开征地补偿协议，这本身可能违反了相关法律法规关于信息公开的规定。您可以先尝试通过合法途径（如向相关部门申请信息公开）获取该协议。
- 如果无法获取，您可能需要收集其他证据来证明您的权益被侵犯，如征地公告、补偿款发放记录、村民会议记录等。
证据的证明力：
- 收集到的证据需要具有足够的证明力，能够证明村委会的行为确实侵犯了您的合法权益。这可能需要专业的法律分析和判断。
三、法律建议
尽快咨询专业律师：
- 鉴于诉讼时效和证据问题的复杂性，我建议您尽快咨询专业律师，对您的具体情况进行详细分析。律师可以帮助您评估胜诉的可能性，并制定合适的诉讼策略。
尝试非诉讼解决方式：
- 在起诉之前，您也可以尝试通过协商、调解等非诉讼方式解决纠纷。这可能更节省时间和成本，也更有利于维护双方的关系。
关注相关法律法规的更新：
- 征地拆迁领域的法律法规可能会随着时间和政策的变化而更新。您需要关注相关法律法规的更新情况，以确保您的权益得到最大程度的保护。
四、可能的法律后果
如果胜诉：
- 如果法院最终判决村委会的行为侵犯了您的合法权益，您可能获得相应的补偿或赔偿。
如果败诉：
- 如果因为诉讼时效已过或证据不足等原因败诉，您可能需要承担诉讼费用，并且无法获得预期的补偿或赔偿。
总结来说，虽然40年后才知道权益被侵犯在诉讼时效上可能面临挑战，但并不意味着完全无法起诉。关键在于您能否提供足够的证据证明您的权益被侵犯，以及法院是否会因为特殊情况而延长诉讼时效。因此，我建议您尽快咨询专业律师，对您的具体情况进行详细分析，并制定合适的诉讼策略。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。