结论前置：要保障第三者把钱还给原配后，原配不再追究，关键在于确保还款行为合法、有效，并尽可能通过书面协议等形式固定双方的权利义务，以减少未来可能出现的纠纷。以下是从不同角度给出的具体分析和建议：
一、还款行为的合法性与有效性
资金来源合法性：
- 第三者还款的资金来源必须合法，不能是非法所得或涉及其他违法犯罪活动的资金。否则，即使还款给原配，也可能因资金来源问题而引发新的法律纠纷。
还款方式与证据：
- 还款应通过银行转账等可追溯的方式进行，并保留好转账记录、收据等证据。这些证据在未来可能出现的纠纷中，将起到至关重要的作用。
- 如果可能，最好通过书面协议明确还款金额、还款方式、还款时间等关键信息，并由双方签字确认。
二、书面协议的签订
协议内容：
- 书面协议应明确双方的权利义务，包括但不限于还款金额、还款期限、是否放弃进一步追究的权利等。
- 协议中可以约定，一旦第三者按照协议约定还款，原配将不再就相关事宜向第三者提出任何要求或追究任何责任。
协议效力：
- 书面协议应符合法律法规的规定，双方意思表示真实，且不存在欺诈、胁迫等情形，以确保协议的合法性和有效性。
- 协议签订后，双方应严格遵守协议约定，履行各自的义务。
三、其他保障措施
公证或见证：
- 如果条件允许，可以对书面协议进行公证或邀请第三方见证，以增加协议的公信力和执行力。
- 公证或见证可以确保协议的真实性和合法性，并在未来可能出现的纠纷中提供有力的证据支持。
法律咨询与审查：
- 在签订书面协议前，建议双方咨询专业律师，对协议内容进行法律审查和修改，以确保协议符合法律法规的规定，并充分保护双方的合法权益。
- 律师可以提供专业的法律意见和建议，帮助双方规避潜在的法律风险。
四、可能面临的法律后果与应对
如果原配反悔：
- 如果原配在第三者还款后反悔，试图继续追究第三者的责任，第三者可以依据书面协议和相关证据进行抗辩。
- 在这种情况下，第三者可以向法院提起诉讼，要求确认协议的效力并维护自己的合法权益。
如果协议存在瑕疵：
- 如果书面协议存在瑕疵或不符合法律法规的规定，可能导致协议无效或部分无效。
- 在这种情况下，第三者应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并采取相应的法律措施进行补救。
最后建议：为了确保第三者还款后原配不再追究，建议双方在还款前签订书面协议，并明确双方的权利义务。同时，保留好还款证据和协议文本，以备不时之需。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。